More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2340 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 472 aa  926    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.57 
 
 		 479 aa  523  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239731  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2236  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.18 
 
 		 481 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.126562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2198  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.18 
 
 		 481 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0460557  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  39.96 
 
 		 496 aa  355  1e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1519  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.87 
 
 		 502 aa  349  5e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.66 
 
 		 657 aa  348  2e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.59 
 
 		 570 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  38.27 
 
 		 490 aa  340  2e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.4 
 
 		 564 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.32 
 
 		 658 aa  333  3e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  39.5 
 
 		 513 aa  329  6e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.46 
 
 		 492 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  39.25 
 
 		 492 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.83 
 
 		 492 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.46 
 
 		 492 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  39.25 
 
 		 492 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  39.25 
 
 		 492 aa  327  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.09 
 
 		 492 aa  326  7e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22510  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.65 
 
 		 494 aa  325  9e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  39.09 
 
 		 513 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.33 
 
 		 482 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  39.04 
 
 		 492 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.23 
 
 		 479 aa  320  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.23 
 
 		 479 aa  320  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.1 
 
 		 484 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1003  lincomycin resistance protein LmrB  36.79 
 
 		 480 aa  315  8e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0734  lincomycin resistance protein  36.79 
 
 		 480 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.498733  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.94 
 
 		 561 aa  313  4.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2376  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.91 
 
 		 643 aa  313  5.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2422  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.91 
 
 		 643 aa  313  5.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.845412  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1028  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.82 
 
 		 491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10576e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.82 
 
 		 491 aa  310  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1468  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.56 
 
 		 491 aa  310  4e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.986472  normal  0.151461 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0988  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.58 
 
 		 491 aa  310  5e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  36.3 
 
 		 465 aa  310  5e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0888  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.82 
 
 		 486 aa  308  9e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.82 
 
 		 486 aa  308  9e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1115  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.15 
 
 		 491 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4325  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.82 
 
 		 491 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.74 
 
 		 635 aa  306  7e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.76 
 
 		 499 aa  298  1e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00395265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0949  permease, general substrate transporter  38.41 
 
 		 482 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000025972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0971  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.18 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0959  permease, general substrate transporter  38.18 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0281229  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.7 
 
 		 579 aa  297  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1038  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.18 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.57 
 
 		 599 aa  297  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1116  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38.18 
 
 		 482 aa  296  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000271146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.95 
 
 		 599 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.81 
 
 		 597 aa  292  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  39.61 
 
 		 599 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.61 
 
 		 599 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  39.61 
 
 		 599 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.61 
 
 		 599 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  35.81 
 
 		 683 aa  290  6e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  39.13 
 
 		 599 aa  289  9e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.79 
 
 		 599 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  39.57 
 
 		 599 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.34 
 
 		 483 aa  281  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257317  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.35 
 
 		 500 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1880  major facilitator superfamily permease  36.74 
 
 		 503 aa  278  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05820  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.39 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.55 
 
 		 496 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1318  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.14 
 
 		 465 aa  270  4e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1383  major facilitator superfamily permease  34.94 
 
 		 519 aa  267  2.9999999999999995e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.601618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.21 
 
 		 620 aa  266  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0354  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-2 (14 Spanner) (DHA2) family protein  33.71 
 
 		 542 aa  265  1e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30030  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.62 
 
 		 487 aa  264  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00171806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0161  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.94 
 
 		 494 aa  262  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0998  putative permease  35.21 
 
 		 548 aa  261  3e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1378  major facilitator superfamily permease  33.87 
 
 		 512 aa  260  3e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0602023  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08630  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.85 
 
 		 509 aa  256  5e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.04 
 
 		 490 aa  256  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.02 
 
 		 489 aa  252  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.69 
 
 		 490 aa  250  5e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.57 
 
 		 579 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02600  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.71 
 
 		 505 aa  243  6e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.81 
 
 		 491 aa  239  5.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.93 
 
 		 514 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11090  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.05 
 
 		 640 aa  237  4e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000431734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5520  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.4 
 
 		 502 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013169  Ksed_14700  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.42 
 
 		 491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0438074  normal  0.116411 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.26 
 
 		 500 aa  220  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000893352  hitchhiker  0.00471574 
 
 
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NC_009513  Lreu_0947  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.57 
 
 		 462 aa  219  7.999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000410718  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.17 
 
 		 492 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013204  Elen_2667  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.91 
 
 		 485 aa  215  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0905281  normal  0.424193 
 
 
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NC_013204  Elen_2756  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.4 
 
 		 471 aa  207  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013165  Shel_23660  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.2 
 
 		 461 aa  207  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.629317  normal  0.503051 
 
 
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NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 		 534 aa  206  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
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NC_008530  LGAS_1423  major facilitator superfamily permease  29.42 
 
 		 464 aa  203  6e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.904673  hitchhiker  0.0000661431 
 
 
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NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 		 545 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
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NC_009513  Lreu_1299  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 479 aa  192  9e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.48 
 
 		 524 aa  189  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_1853  major facilitator superfamily permease  30 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010333  Caul_5403  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.01 
 
 		 537 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009513  Lreu_0360  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 461 aa  184  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_0192  major facilitator superfamily permease  29.56 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.99 
 
 		 510 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.81 
 
 		 543 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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