225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1015 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  786    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  87.8 
 
 		 381 aa  707    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  87.8 
 
 		 381 aa  707    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  57.8 
 
 		 380 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  56.49 
 
 		 384 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  54.42 
 
 		 379 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  53.78 
 
 		 379 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  53.78 
 
 		 379 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  53.78 
 
 		 379 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  53.78 
 
 		 379 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  53.78 
 
 		 379 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  53.78 
 
 		 379 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  53.78 
 
 		 379 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  53.78 
 
 		 379 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  53.89 
 
 		 379 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  53.24 
 
 		 381 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0925  putative RNA methylase  51.05 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2429  putative RNA methylase  49.6 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0287  putative RNA methylase  49.6 
 
 		 379 aa  385  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2939  putative RNA methylase  47.85 
 
 		 390 aa  378  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000322588  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1378  N6-adenine-specific DNA methylase  50.27 
 
 		 377 aa  377  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  49.07 
 
 		 377 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  47.99 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  47.45 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3084  putative RNA methylase  48.53 
 
 		 378 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0028  hypothetical protein  46.44 
 
 		 400 aa  357  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138235  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0282  hypothetical protein  48.53 
 
 		 388 aa  355  5e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.439028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  47.17 
 
 		 379 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1081  N6-adenine-specific DNA methylase  47.88 
 
 		 376 aa  348  1e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0303  hypothetical protein  46.93 
 
 		 384 aa  345  8e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00482447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1020  N6-adenine-specific DNA methylase  44.5 
 
 		 374 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  47.71 
 
 		 375 aa  335  5.999999999999999e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  47.71 
 
 		 375 aa  333  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4151  putative RNA methylase  46.26 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.949301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  44.06 
 
 		 380 aa  324  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1816  N6-adenine-specific DNA methylase  45.62 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0979861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1763  putative RNA methylase  43.55 
 
 		 371 aa  296  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  38.46 
 
 		 375 aa  256  5e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  33.78 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  32.97 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  33.33 
 
 		 391 aa  222  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  32.79 
 
 		 375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0180  putative RNA methylase  35.23 
 
 		 340 aa  206  7e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1362  hypothetical protein  35.82 
 
 		 484 aa  205  1e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  31.89 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  31.89 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  31.89 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  32.16 
 
 		 376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.87 
 
 		 712 aa  200  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.38 
 
 		 709 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.59 
 
 		 711 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  31.12 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.12 
 
 		 709 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.12 
 
 		 709 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0938  hypothetical protein  32.83 
 
 		 403 aa  195  9e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.493272  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.12 
 
 		 709 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.13 
 
 		 709 aa  194  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2256  N6-adenine-specific DNA methylase  31.42 
 
 		 369 aa  193  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00159755  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  32.02 
 
 		 385 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  31.72 
 
 		 374 aa  189  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.97 
 
 		 711 aa  189  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  30.77 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1018  putative RNA methylase  33.42 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2250  putative RNA methylase  32.43 
 
 		 380 aa  186  4e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.959304  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.72 
 
 		 713 aa  187  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.46 
 
 		 713 aa  186  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.69 
 
 		 749 aa  186  8e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.46 
 
 		 713 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.13 
 
 		 711 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.24 
 
 		 711 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.55 
 
 		 708 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1420  putative RNA methylase  30.87 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00712049  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  31.81 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  29.38 
 
 		 399 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.19 
 
 		 708 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08561  putative N6-adenine-specific DNA methylase  31.82 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.24 
 
 		 699 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2424  N6-adenine-specific DNA methylase  32.52 
 
 		 398 aa  176  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  31.78 
 
 		 387 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03361  RNA methylase family protein  30.38 
 
 		 374 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1699  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.26 
 
 		 722 aa  176  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.29 
 
 		 711 aa  176  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.67 
 
 		 715 aa  176  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0196  putative RNA methylase  31.76 
 
 		 395 aa  176  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.289998 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0282  putative RNA methylase:THUMP  30.45 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377639  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1488  hypothetical protein  30.77 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00216876  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  29.54 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  30.91 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.21 
 
 		 718 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.27 
 
 		 725 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  0.0000000000188031 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0023  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.42 
 
 		 707 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02337  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.12 
 
 		 707 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0022  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.69 
 
 		 707 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003438  23S rRNA (guanine-N-2-) -methyltransferase RlmL  30.61 
 
 		 706 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2096  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.53 
 
 		 730 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3643  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.53 
 
 		 730 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3255  RNA methylase family protein  28.87 
 
 		 392 aa  170  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.01 
 
 		 721 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0401  putative RNA methylase  29.89 
 
 		 387 aa  170  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.76 
 
 		 713 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>