More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0364 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0364  sensor histidine kinase SaeS  100 
 
 		 321 aa  656    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0729  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.23 
 
 		 351 aa  492  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0745  ATPase domain-containing protein  78.23 
 
 		 351 aa  492  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0394  sensor histidine kinase  34.53 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.372453  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 470 aa  136  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  30.23 
 
 		 466 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 359 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 466 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 466 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 466 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 466 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  29.9 
 
 		 466 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  29.9 
 
 		 466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  29.58 
 
 		 466 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  29.24 
 
 		 508 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  28.74 
 
 		 484 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  29.48 
 
 		 484 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  28.84 
 
 		 484 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  28.74 
 
 		 484 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  28.84 
 
 		 484 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  28.84 
 
 		 484 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  28.84 
 
 		 484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 471 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 487 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  28.09 
 
 		 484 aa  125  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5512  histidine kinase  29.94 
 
 		 359 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 459 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1579  histidine kinase  30.43 
 
 		 583 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 583 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 592 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 453 aa  122  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 513 aa  122  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  28.39 
 
 		 466 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  28 
 
 		 360 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  32.6 
 
 		 537 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  31.75 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  32.69 
 
 		 480 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 631 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  31.75 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  32.43 
 
 		 501 aa  120  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 585 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 358 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  28.06 
 
 		 466 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  28.7 
 
 		 589 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 607 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 584 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0283  ATPase domain-containing protein  28.81 
 
 		 411 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143698  hitchhiker  0.000000382002 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 584 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 599 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 614 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 581 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 600 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 463 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 489 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0282  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 411 aa  116  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000209269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3739  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 411 aa  116  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0303484 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  32.22 
 
 		 354 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 394 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 444 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 471 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  27.44 
 
 		 496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0192  ATP-binding region ATPase domain protein  30.27 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.1922 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 596 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 589 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 604 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  29.74 
 
 		 587 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  29.74 
 
 		 587 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  29.74 
 
 		 587 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  29.74 
 
 		 587 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 608 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 587 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  29.82 
 
 		 376 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 500 aa  113  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4427  sensor histidine kinase  27.81 
 
 		 418 aa  113  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  29.74 
 
 		 587 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 590 aa  113  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 401 aa  113  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 458 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  30.17 
 
 		 587 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1757  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 614 aa  113  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  30.17 
 
 		 587 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 		 970 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  25.24 
 
 		 356 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 460 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  29.74 
 
 		 587 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 376 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 594 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  30.77 
 
 		 584 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  29.31 
 
 		 587 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 468 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>