More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0309 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0309  lipase/esterase, putative  100 
 
 
349 aa  721    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0693  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.76 
 
 
347 aa  497  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0470894  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0678  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.76 
 
 
347 aa  497  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3921  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.57 
 
 
351 aa  236  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0169  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.04 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0172  putative esterase  36 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.32739  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3173  acetyl esterase, putative  38.54 
 
 
341 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3188  acetyl esterase, putative  39.1 
 
 
341 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.210653  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1865  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.21 
 
 
338 aa  179  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1114  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.98 
 
 
380 aa  153  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000135139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3439  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.81 
 
 
326 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0114  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.32 
 
 
339 aa  139  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0114  lipase/esterase, putative  31.32 
 
 
339 aa  139  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3093  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.62 
 
 
326 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1573  esterase/lipase  26.62 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.27 
 
 
314 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.86 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2140  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.37 
 
 
306 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  27 
 
 
314 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.51 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.13 
 
 
422 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.58 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.83 
 
 
324 aa  86.7  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1786  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.81 
 
 
317 aa  86.7  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  hitchhiker  0.00646519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2787  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  26.27 
 
 
328 aa  86.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  0.113664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  26.42 
 
 
644 aa  86.3  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04980  esterase/lipase  25.6 
 
 
305 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  27.04 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3668  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.17 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2058  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.52 
 
 
369 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.217976  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.83 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  27.15 
 
 
431 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.76 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  25.88 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.08 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.03 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3254  lipase  27.69 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0525665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0735  esterase  27.24 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  26.01 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1005  lipase  27.24 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.50865  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.35 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.42 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.45 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  27.24 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3664  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.72 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0552  acetyl esterase  20.88 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1001  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.89 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  24.58 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  24.58 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  26.87 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  26.87 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.44 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  24.71 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.26 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0536  acetyl esterase  20.88 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0542  acetyl esterase  20.88 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.44 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3667  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.62 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.69 
 
 
420 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1444  Alpha/beta hydrolase fold-3  22.81 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.290312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3458  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.15 
 
 
306 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  22.81 
 
 
311 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0537  acetyl esterase  20.48 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1943  esterase/lipase  29.7 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.35 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0226  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.7 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.34 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  22.09 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  24.59 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.64 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12506  carboxylesterase lipQ  25.51 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329664  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  25.44 
 
 
337 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.57 
 
 
337 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.64 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.53 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.66 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1004  heroin esterase  26.05 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.100661  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3151  Alpha/beta hydrolase fold-3  23.42 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.59 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.68 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  24.9 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0407  acetyl esterase  21.78 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  22.54 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.43 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23980  esterase/lipase  22.41 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0318  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.66 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.82 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  26.36 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  25 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.34 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0514  acetyl esterase  22.12 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.85 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  22.91 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.42 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  24.68 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.72 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.56 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.56 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  22.43 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00432  hypothetical protein  22.12 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>