63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_R0044 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_R0044  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00954192  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0011  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623818  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0032  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.151331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0007  tRNA-Thr  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0020  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.868603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0030  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.582099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0030  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0012  tRNA-Thr  95 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0038  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.63633e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0049  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0010  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0051  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1716  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000136572  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0436  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1469  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000598832  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.607965  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0064  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00190165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0046  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712276  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1354  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0033  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190233  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0023  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.234998  normal  0.014223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0023  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0042  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0043  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478862  hitchhiker  0.000308471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0027  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0953414  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0045  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0046  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871205  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0043  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0013  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0026  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0050  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0055  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000044342  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0051  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09730  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0009  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0061  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.502238  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0023  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0044  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146176  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31670  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0008  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0245883  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0046  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497461 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0026  tRNA-Val  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.218598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0017  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0090775  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0020  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0050  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04020  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.730789  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0047  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.424478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0048  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0088  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241374 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t45  tRNA-Thr  100 
 
 		 130 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00118022  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0003  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194068  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0003  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.203261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0053  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0003  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0078  tRNA-Thr  88 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255536  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0037  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.928979  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0011  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0009  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0475152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0024  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00921626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>