More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4103 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009007  RSP_3935  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit  99.6 
 
 
497 aa  952    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.455536  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4103  ATP synthase F1, alpha subunit  100 
 
 
497 aa  959    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0134913  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1885  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.14 
 
 
510 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0879266  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2779  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.39 
 
 
504 aa  580  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.470369 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0043  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.74 
 
 
530 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112939 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5553  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.99 
 
 
522 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175535  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0426  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.95 
 
 
556 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259702  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19740  ATP synthase F1, alpha subunit  60.53 
 
 
513 aa  555  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0154  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.13 
 
 
670 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325143  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.13 
 
 
670 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0130  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.13 
 
 
670 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2787  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.51 
 
 
670 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1122  ATP synthase F1, alpha subunit  61.27 
 
 
525 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2645  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.51 
 
 
666 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.727067  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1048  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.51 
 
 
664 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1050  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.02 
 
 
517 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.67 
 
 
502 aa  455  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.35 
 
 
505 aa  457  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.22 
 
 
502 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.22 
 
 
502 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50 
 
 
502 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.23 
 
 
501 aa  449  1e-125  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0287666  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  48.17 
 
 
501 aa  449  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.91 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.91 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.91 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.91 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.91 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0945  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit alpha  53.67 
 
 
585 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.670591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.91 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.91 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.91 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1405  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.56 
 
 
505 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0699258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.91 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.91 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49 
 
 
502 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.34 
 
 
502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1022  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.24 
 
 
553 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0861  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 
501 aa  442  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0205389  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.25 
 
 
505 aa  443  1e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.47 
 
 
502 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.47 
 
 
502 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.12 
 
 
503 aa  445  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0132  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.63 
 
 
509 aa  443  1e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.59 
 
 
505 aa  445  1e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.37 
 
 
505 aa  443  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 
501 aa  442  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.45 
 
 
503 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.34 
 
 
504 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.12 
 
 
502 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1070  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.82 
 
 
511 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1070  ATP synthase F1, alpha subunit  47.53 
 
 
542 aa  440  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.13 
 
 
501 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0295232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3709  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.02 
 
 
552 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.78 
 
 
509 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2329  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.26 
 
 
520 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6064  ATP synthase F1, alpha subunit  50.57 
 
 
512 aa  440  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2450  ATP synthase F1, alpha subunit  48.16 
 
 
543 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.13 
 
 
501 aa  438  1e-121  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2996  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.38 
 
 
522 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1168  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.74 
 
 
534 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295877  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.13 
 
 
501 aa  437  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.241383  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2675  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50 
 
 
528 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3056  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.65 
 
 
517 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.46 
 
 
504 aa  435  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  49.65 
 
 
508 aa  433  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02280  ATP synthase alpha chain, mitochondrial precursor, putative  47.52 
 
 
540 aa  434  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0083  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.55 
 
 
509 aa  433  1e-120  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  48.88 
 
 
502 aa  434  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18220  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.02 
 
 
549 aa  435  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.850315  normal  0.256257 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3364  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.12 
 
 
502 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.677346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.89 
 
 
502 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.68 
 
 
509 aa  435  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  45.6 
 
 
507 aa  434  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.24 
 
 
505 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.57 
 
 
502 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.41 
 
 
505 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.67 
 
 
502 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3099  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.26 
 
 
571 aa  431  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665351  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.38 
 
 
510 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.77 
 
 
504 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  44.76 
 
 
507 aa  430  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 
510 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.11 
 
 
505 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08160  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.78 
 
 
555 aa  430  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.35 
 
 
511 aa  430  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  49.09 
 
 
507 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 
510 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.41 
 
 
509 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.1 
 
 
502 aa  430  1e-119  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.89 
 
 
505 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.62 
 
 
509 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1961  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.09 
 
 
510 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.938875  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.97 
 
 
502 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.22 
 
 
505 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10010  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  47.5 
 
 
543 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.564506  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0651  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.23 
 
 
554 aa  429  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.310941  normal  0.421508 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.72 
 
 
503 aa  428  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0663  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.02 
 
 
520 aa  426  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0131395  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.18 
 
 
544 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206364  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>