34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2748 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2748  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  348  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2975  hypothetical protein  80.98 
 
 		 185 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.701427 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1315  hypothetical protein  79.89 
 
 		 185 aa  239  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215271  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2950  hypothetical protein  47.64 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.283763 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4183  hypothetical protein  42.93 
 
 		 205 aa  121  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3261  hypothetical protein  42.55 
 
 		 201 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  38.21 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  36.13 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3427  hypothetical protein  32.19 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0467043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  31.58 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  31.5 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  29.53 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  30.4 
 
 		 267 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  28.99 
 
 		 255 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  29.2 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0818  hypothetical protein  29.27 
 
 		 286 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0307205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  30.71 
 
 		 256 aa  48.9  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0058  hypothetical protein  26.67 
 
 		 170 aa  48.5  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0261  hypothetical protein  28.44 
 
 		 179 aa  47.8  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.74612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  23.91 
 
 		 238 aa  47.8  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0355  putative exported flagella related protein  26.96 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900636  normal  0.0456506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  28.04 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  29.93 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  28.35 
 
 		 254 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0743  hypothetical protein  27.27 
 
 		 189 aa  45.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.634607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4202  hypothetical protein  29.6 
 
 		 310 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0323  putative exported flagella related protein  26.92 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547505  normal  0.420326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4717  hypothetical protein  31.45 
 
 		 295 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194174  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3052  hypothetical protein  30.4 
 
 		 265 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3250  hypothetical protein  28.1 
 
 		 265 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3276  hypothetical protein  30.4 
 
 		 265 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1786  MTA/SAH nucleosidase  27.63 
 
 		 188 aa  42  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000723674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  24.32 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1436  hypothetical protein  22.4 
 
 		 258 aa  41.2  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>