61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1804 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1804  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
144 aa  285  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4399  transposase IS3/IS911 family protein  97.73 
 
 
135 aa  255  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134241  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3698  hypothetical protein  97.73 
 
 
135 aa  255  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.451428 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3198  transposase IS3/IS911 family protein  83.33 
 
 
135 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4110  hypothetical protein  72.73 
 
 
133 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8376  transposase IS3/IS911 family protein  37.12 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  35.94 
 
 
133 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  35.94 
 
 
133 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1582  hypothetical protein  40.8 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.447037 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2997  transposase IS3/IS911  37.93 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4786  transposase IS3/IS911 family protein  34.71 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2730  transposase IS3/IS911 family protein  34.71 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777363  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0900  transposase IS3/IS911 family protein  34.71 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.825197  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  36.64 
 
 
120 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  46.27 
 
 
131 aa  53.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  46.27 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  46.27 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  39.08 
 
 
151 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  41.03 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  30.88 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  30.88 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  31.17 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  40.85 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  40.85 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  40.85 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  52.83 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  38.27 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4930  hypothetical protein  51.92 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.527295  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  47.46 
 
 
154 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0709  transposase IS3/IS911 family protein  35.05 
 
 
124 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.668336  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  30.53 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  36.73 
 
 
152 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  34.65 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  34.65 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  34.65 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  29.91 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  33.61 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0786  transposase IS3/IS911 family protein  33.88 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  36.36 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  36.36 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  38.33 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  30.25 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  36.11 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  38.03 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  45.83 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  38.67 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  45.83 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  38.03 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4915  transposase IS3/IS911 family protein  29.84 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.269908 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  38.33 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  37.1 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  37.1 
 
 
122 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  37.1 
 
 
122 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  37.66 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  34.38 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  29.63 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>