More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1774 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1774  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
315 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.608218 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2738  rhodanese-related sulfurtransferase  85.08 
 
 
315 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.848314  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1396  rhodanese domain-containing protein  84.76 
 
 
315 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260045  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2561  rhodanese domain-containing protein  44.91 
 
 
324 aa  238  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.918662  normal  0.131407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2054  Rhodanese domain protein  46.43 
 
 
317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0105049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1650  rhodanese domain-containing protein  46.43 
 
 
317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  0.100041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0562  Rhodanese domain protein  41.51 
 
 
331 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1180  thiosulfate sulfurtransferase  37.99 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384238  normal  0.0141759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3785  rhodanese-like protein  36.13 
 
 
303 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5900  rhodanese domain-containing protein  34.9 
 
 
303 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688028  normal  0.469982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0500  rhodanese domain-containing protein  34.39 
 
 
313 aa  142  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.346469  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0346  rhodanese domain-containing protein  36.82 
 
 
333 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0560  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 
329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000058867  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0792  rhodanese domain-containing protein  28.8 
 
 
325 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2047  rhodanese-like protein  27.61 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000810205  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  26.35 
 
 
320 aa  98.2  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  29.53 
 
 
276 aa  96.3  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  30.74 
 
 
355 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  29.79 
 
 
477 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  29.2 
 
 
279 aa  93.6  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  29.2 
 
 
281 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  30.86 
 
 
279 aa  90.1  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4532  rhodanese-like protein  28.11 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  27.69 
 
 
340 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 
284 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0501  rhodanese domain-containing protein  28.08 
 
 
285 aa  89.7  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  27.08 
 
 
276 aa  89.4  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  26.79 
 
 
293 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2873  Rhodanese domain protein  23.42 
 
 
327 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.812783 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  27.1 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  27.6 
 
 
279 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  28.4 
 
 
277 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  28.4 
 
 
277 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  29.53 
 
 
281 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  28.46 
 
 
284 aa  86.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  25.62 
 
 
321 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  34.19 
 
 
288 aa  86.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4079  rhodanese-like protein  25 
 
 
321 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.361854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  30.52 
 
 
280 aa  86.3  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  25.62 
 
 
321 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  29.2 
 
 
277 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  29.2 
 
 
277 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  29.2 
 
 
277 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  27.49 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  28.83 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  33.82 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  28.92 
 
 
277 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  31.9 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  27.2 
 
 
279 aa  84  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  27.24 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  27.4 
 
 
285 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  26.15 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  25.08 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  30.23 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  29.58 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0198  Rhodanese domain protein  27.1 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  30.04 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  26 
 
 
279 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  26.24 
 
 
275 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  27.8 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  30.98 
 
 
277 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  34.1 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  27.18 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  27.64 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  28.3 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.18 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  32.38 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  26.37 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  27.87 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  26.41 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  29.25 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1647  rhodanese domain-containing protein  30.17 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.368982  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  26.4 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  26.18 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.75 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  29.71 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  30.09 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  30.42 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  26.67 
 
 
277 aa  79  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.83 
 
 
289 aa  79  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  28.78 
 
 
272 aa  79  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.15 
 
 
627 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  29.1 
 
 
278 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  28.82 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1422  rhodanese domain-containing protein  29.63 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  27.31 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  27.52 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  30.18 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  28.4 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  23.84 
 
 
291 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  26.85 
 
 
277 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0747  rhodanese domain-containing protein  27.56 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.544739 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  28.4 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  31.05 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  27.63 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  25.29 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>