More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1336 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
344 aa  687    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0601175  normal  0.898659 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1788  enoyl-CoA hydratase/isomerase  78.07 
 
 
343 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149813  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0155  enoyl-CoA hydratase  77.78 
 
 
343 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1102  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.21 
 
 
347 aa  378  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1751  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  56.61 
 
 
348 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.42983 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.23 
 
 
346 aa  348  5e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.44511  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.43 
 
 
335 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130817  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6082  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.9 
 
 
335 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0616  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.82 
 
 
344 aa  259  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423335  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3936  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.68 
 
 
357 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2121  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.68 
 
 
357 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406084  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.69 
 
 
346 aa  255  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.540353  hitchhiker  0.0000619803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2157  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.86 
 
 
357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.335235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7569  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.82 
 
 
352 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4680  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.03 
 
 
347 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.706752  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2037  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.83 
 
 
360 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.820992  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3092  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.79 
 
 
357 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.221935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6833  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.79 
 
 
353 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3300  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.47 
 
 
357 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3783  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.38 
 
 
353 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0969949  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2557  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.17 
 
 
357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3580  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.17 
 
 
350 aa  242  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1790  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.67 
 
 
354 aa  242  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.316766  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4186  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.15 
 
 
417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000141548  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0753  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.23 
 
 
349 aa  237  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2535  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.48 
 
 
350 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1543  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.53 
 
 
355 aa  236  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0256102  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0758  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.23 
 
 
349 aa  235  8e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571956  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0624  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.97 
 
 
365 aa  230  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4230  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.35 
 
 
345 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4155  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.35 
 
 
345 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4386  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.35 
 
 
345 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230792  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1455  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.44 
 
 
356 aa  229  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0257  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.15 
 
 
350 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0859  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.24 
 
 
348 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209599  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4173  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.85 
 
 
355 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1954  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.54 
 
 
349 aa  226  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0903  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.54 
 
 
350 aa  226  7e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3165  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.3 
 
 
334 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.56 
 
 
351 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0229  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.57 
 
 
350 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2060  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.8 
 
 
356 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.8 
 
 
379 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.72 
 
 
350 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.615886  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3054  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.47 
 
 
352 aa  216  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.84 
 
 
336 aa  215  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.551521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4296  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
356 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0421  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.07 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.42 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554975  normal  0.656952 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0649  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0753828  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2884  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.28 
 
 
356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4237  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.94 
 
 
386 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4607  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 
444 aa  210  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0889202  normal  0.685033 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1130  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.24 
 
 
349 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106134  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1504  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.16 
 
 
339 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.643881 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2130  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
361 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0313318  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2437  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
356 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484905  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0631  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.79 
 
 
359 aa  205  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4756  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.94 
 
 
409 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.977722 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.44 
 
 
379 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.611777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.07 
 
 
360 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206594  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1527  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.54 
 
 
334 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1222  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.81 
 
 
369 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.39 
 
 
358 aa  202  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3491  enoly-coenzyme A hydratase/isomerase family protein  36.26 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02830  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.03 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.562739  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.65 
 
 
368 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.298251  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2280  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
357 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5131  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 
383 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469917  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4380  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.83 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.12865 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0933  hypothetical protein  33.82 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0719  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.97 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33689  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.36 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.260667 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3409  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.36 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5328  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.26 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0116155  normal  0.0410318 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1742  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.92 
 
 
374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.92 
 
 
350 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0902  hypothetical protein  33.82 
 
 
352 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2495  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.36 
 
 
376 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0249  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.76 
 
 
370 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.54 
 
 
379 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.0486568 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4242  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.68 
 
 
356 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.79779  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1732  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  30.95 
 
 
350 aa  196  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.942683  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01520  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.65 
 
 
359 aa  195  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2887  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.94 
 
 
355 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1131  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.12 
 
 
414 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663045  normal  0.545416 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2163  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.63 
 
 
350 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0211333  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2019  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.57 
 
 
360 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2457  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.94 
 
 
351 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0809825  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1089  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.82 
 
 
382 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0147418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2384  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.24 
 
 
351 aa  192  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25475  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1298  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.71 
 
 
376 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0260936  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.42 
 
 
365 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2431  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.26 
 
 
394 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.843563  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2322  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  30.88 
 
 
351 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3002  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.54 
 
 
351 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0905193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2556  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.75 
 
 
363 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2375  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  30.75 
 
 
351 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32846  enoyl-CoA hydratase, mitochondrial  29.08 
 
 
475 aa  189  7e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.726842  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1461  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.57 
 
 
387 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>