More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0530 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  86.45 
 
 		 407 aa  714    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  86.95 
 
 		 407 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 407 aa  822    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  58.91 
 
 		 405 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  55.53 
 
 		 443 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  50.73 
 
 		 407 aa  396  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  48.93 
 
 		 420 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  50.86 
 
 		 413 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  54.17 
 
 		 409 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  55.28 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  47.92 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  46.93 
 
 		 428 aa  352  8e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  46.94 
 
 		 410 aa  351  1e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  48.08 
 
 		 402 aa  350  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  45.7 
 
 		 406 aa  349  6e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  46.21 
 
 		 415 aa  347  2e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  42.72 
 
 		 407 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  46.65 
 
 		 412 aa  340  2e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  46.48 
 
 		 408 aa  334  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  45.48 
 
 		 411 aa  330  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  43.6 
 
 		 406 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  44.44 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  41.15 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  44.88 
 
 		 415 aa  293  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  41.5 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  44.35 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  40.76 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  44.97 
 
 		 425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  42.89 
 
 		 412 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  41.52 
 
 		 406 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  43.84 
 
 		 412 aa  280  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  46.97 
 
 		 369 aa  279  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  43.04 
 
 		 460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  38.77 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  40.57 
 
 		 518 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 		 403 aa  262  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  40.44 
 
 		 437 aa  259  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  43.38 
 
 		 390 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  36.88 
 
 		 401 aa  249  9e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  31.88 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 406 aa  156  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  26.03 
 
 		 412 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.95 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  53.64 
 
 		 188 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  53.64 
 
 		 188 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0056  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0299  glycosyl transferase, group 1  22.31 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120418  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.89 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0185  glycosyl transferase, group 1  42.67 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.634207 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  26.02 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 371 aa  57  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  29.86 
 
 		 411 aa  57  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  23.49 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.69 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  27.43 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 536 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  27.83 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  26.42 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  26.12 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 		 383 aa  53.9  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  22.94 
 
 		 364 aa  53.5  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.7 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  22.6 
 
 		 539 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 		 458 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 377 aa  53.5  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 		 383 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 387 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2628  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 		 410 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00259804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 		 419 aa  53.1  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.27 
 
 		 388 aa  53.1  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  30.77 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>