More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2738 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2738  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 540 aa  1092    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0513  glycosyl transferase, group 1  34.77 
 
 		 924 aa  204  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0172  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 		 991 aa  200  5e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.2 
 
 		 711 aa  179  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.317292  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1809  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 780 aa  177  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.203841  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0061  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0170  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 		 454 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 885 aa  160  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27940  glycosyltransferase  31.25 
 
 		 739 aa  94.4  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5364  hypothetical protein  25.51 
 
 		 714 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5122  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.51 
 
 		 550 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5514  group 1 family glycosyl transferase  25.51 
 
 		 550 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08950  glycosyltransferase  28.57 
 
 		 731 aa  83.2  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.691292  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26690  glycosyltransferase  30.25 
 
 		 644 aa  80.5  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4979  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 		 332 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31576  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2527  glycosyltransferase  30.3 
 
 		 726 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4969  glycosyltransferase  24.8 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09050  hypothetical protein  30.08 
 
 		 611 aa  73.6  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.06128  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3848  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 		 751 aa  67.4  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 219 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  33.64 
 
 		 201 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  41.28 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1603  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.535279  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1583  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.634707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  34.21 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 214 aa  57  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.43 
 
 		 390 aa  56.6  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  33.01 
 
 		 207 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1533  GumH protein  28.49 
 
 		 380 aa  55.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  27.73 
 
 		 350 aa  55.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 248 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 248 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.75 
 
 		 234 aa  55.1  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 352 aa  55.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  30 
 
 		 350 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.75 
 
 		 243 aa  55.1  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  31.79 
 
 		 344 aa  55.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  24.59 
 
 		 350 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 		 344 aa  54.7  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 421 aa  54.3  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 		 351 aa  54.3  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 201 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 201 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  33.66 
 
 		 242 aa  54.3  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  25.68 
 
 		 350 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 201 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  25.14 
 
 		 350 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 350 aa  53.9  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  29.29 
 
 		 264 aa  53.9  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1077  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 		 325 aa  53.9  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.508973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 678 aa  53.9  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 		 394 aa  53.9  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1477  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 380 aa  53.5  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0885553  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  25.84 
 
 		 362 aa  53.5  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  30.95 
 
 		 201 aa  53.5  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 		 344 aa  53.5  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 197 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 		 370 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0944  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase  33.01 
 
 		 263 aa  53.5  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  30.89 
 
 		 222 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6015  GumH protein  31.54 
 
 		 397 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 		 394 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  36.63 
 
 		 400 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  40.68 
 
 		 218 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 		 394 aa  53.5  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  37.1 
 
 		 422 aa  53.5  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.22 
 
 		 382 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  25.81 
 
 		 269 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3445  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 269 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4557  thiopurine S-methyltransferase  29.77 
 
 		 229 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 197 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  30.73 
 
 		 377 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  35.24 
 
 		 205 aa  52.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.65 
 
 		 254 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  32.08 
 
 		 392 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  44.07 
 
 		 215 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.45 
 
 		 233 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  31.43 
 
 		 203 aa  52.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 348 aa  52.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 252 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  34.95 
 
 		 211 aa  52  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  32.08 
 
 		 201 aa  52  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  36.28 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 377 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  34.56 
 
 		 373 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 222 aa  51.6  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 277 aa  51.2  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 387 aa  51.6  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 		 285 aa  51.2  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 		 446 aa  51.2  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0851  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 		 416 aa  51.6  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 228 aa  51.6  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>