More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2204 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  763    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  54.01 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  50.77 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  51.8 
 
 		 389 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  50.52 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  51.33 
 
 		 364 aa  363  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  52.48 
 
 		 376 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  53.72 
 
 		 370 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  51.87 
 
 		 384 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  51.21 
 
 		 375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  50 
 
 		 364 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  56.59 
 
 		 372 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  53.18 
 
 		 394 aa  352  7e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  50 
 
 		 378 aa  351  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  50.94 
 
 		 382 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  55.39 
 
 		 372 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  49.46 
 
 		 382 aa  349  5e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  50.53 
 
 		 373 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  50.4 
 
 		 373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  51.85 
 
 		 415 aa  343  4e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  46.74 
 
 		 357 aa  339  5.9999999999999996e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  49.87 
 
 		 379 aa  338  7e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  51.2 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  48.01 
 
 		 374 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  54.08 
 
 		 368 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  48.1 
 
 		 361 aa  336  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  49.87 
 
 		 386 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0506  protein of unknown function DUF59  47.99 
 
 		 394 aa  328  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  47.92 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  44.63 
 
 		 354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  47.48 
 
 		 374 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  45.58 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  46.58 
 
 		 363 aa  316  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  44.92 
 
 		 363 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  49.11 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.36 
 
 		 362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  45.04 
 
 		 363 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0858  ParA family protein  58.17 
 
 		 362 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.24 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1614  ParA family protein  57.79 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0712  ParA family protein  57.79 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1055  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  57.79 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1061  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  57.79 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2985  ParA family protein  57.79 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2301  ParA family protein  57.79 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  44.47 
 
 		 362 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1213  putative ATP-binding protein  57.79 
 
 		 362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  47.67 
 
 		 362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  58.13 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  58.13 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  56.37 
 
 		 361 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  44.9 
 
 		 362 aa  302  7.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  43.94 
 
 		 374 aa  302  8.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  45.69 
 
 		 365 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  45.08 
 
 		 363 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  46.15 
 
 		 363 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.18 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  44.79 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  44.2 
 
 		 362 aa  299  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  45.05 
 
 		 362 aa  299  5e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.04 
 
 		 363 aa  299  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  55.6 
 
 		 363 aa  297  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.65 
 
 		 363 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  52.77 
 
 		 286 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.68 
 
 		 363 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  45.31 
 
 		 364 aa  296  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  46.67 
 
 		 362 aa  295  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  46.67 
 
 		 362 aa  295  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  58.7 
 
 		 363 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0681  septum formation inhibitor-activating ATPase-like protein  48.2 
 
 		 355 aa  295  9e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418052  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  55.13 
 
 		 365 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  47.11 
 
 		 363 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.64 
 
 		 363 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.64 
 
 		 363 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.64 
 
 		 363 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2093  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  48.48 
 
 		 353 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  56.97 
 
 		 371 aa  292  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.240141 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0769  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  48.21 
 
 		 353 aa  292  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.13 
 
 		 362 aa  291  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  49.86 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  44.5 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  55.38 
 
 		 371 aa  291  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  44.5 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  56.92 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  56.57 
 
 		 371 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  42.36 
 
 		 388 aa  290  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  41.02 
 
 		 363 aa  289  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  46.03 
 
 		 363 aa  289  7e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0507  MRP-like protein  48.04 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  54.75 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2476  hypothetical protein  46.72 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.840509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  43.43 
 
 		 353 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  43.43 
 
 		 353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  42.21 
 
 		 373 aa  282  5.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  41.67 
 
 		 364 aa  281  9e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.32 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1098  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.23 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1138  hypothetical protein  43.23 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192644  normal  0.84977 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.51 
 
 		 348 aa  281  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  52.71 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>