268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0361 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0361  5'-methylthioadenosine phosphorylase  100 
 
 
294 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2947  5'-methylthioadenosine phosphorylase  66.32 
 
 
297 aa  388  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3751  5'-methylthioadenosine phosphorylase  63.48 
 
 
295 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0276  5'-methylthioadenosine phosphorylase  65.85 
 
 
305 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2245  methylthioadenosine phosphorylase  64.73 
 
 
297 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0274311  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2324  5'-methylthioadenosine phosphorylase  62.85 
 
 
290 aa  368  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2068  5'-methylthioadenosine phosphorylase  62.15 
 
 
289 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250536  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1837  5'-methylthioadenosine phosphorylase  62.37 
 
 
290 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0647  5'-methylthioadenosine phosphorylase  61.67 
 
 
291 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5308  5'-methylthioadenosine phosphorylase  61.32 
 
 
291 aa  361  8e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0486  5'-methylthioadenosine phosphorylase  62.02 
 
 
290 aa  361  8e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4408  5'-methylthioadenosine phosphorylase  60.28 
 
 
291 aa  361  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0626  5'-methylthioadenosine phosphorylase  61.67 
 
 
290 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4698  5'-methylthioadenosine phosphorylase  61.05 
 
 
301 aa  358  4e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.99149  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4937  5'-methylthioadenosine phosphorylase  60 
 
 
291 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3207  5'-methylthioadenosine phosphorylase  57.89 
 
 
289 aa  342  5.999999999999999e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  59.3 
 
 
291 aa  335  5e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2545  5'-methylthioadenosine phosphorylase  56.49 
 
 
291 aa  322  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2768  5'-methylthioadenosine phosphorylase  56.49 
 
 
291 aa  322  7e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  56.69 
 
 
291 aa  318  6e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2145  5'-methylthioadenosine phosphorylase  57.39 
 
 
295 aa  317  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6795  5'-methylthioadenosine phosphorylase  57.64 
 
 
291 aa  315  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.49655  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7534  5'-methylthioadenosine phosphorylase  57.84 
 
 
291 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0739  methylthioadenosine phosphorylase  54.2 
 
 
290 aa  309  2.9999999999999997e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.104422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2475  5'-methylthioadenosine phosphorylase  57.54 
 
 
291 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499312  normal  0.0205304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1112  methylthioadenosine phosphorylase  54.31 
 
 
286 aa  288  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2684  methylthioadenosine phosphorylase  53.77 
 
 
287 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000567778  normal  0.547568 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2626  methylthioadenosine phosphorylase  52.25 
 
 
292 aa  286  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1653  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.78 
 
 
290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.389346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3520  methylthioadenosine phosphorylase  50.53 
 
 
290 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0923  5'-methylthioadenosine phosphorylase  50 
 
 
291 aa  278  5e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1393  methylthioadenosine phosphorylase  50.18 
 
 
287 aa  278  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1582  methylthioadenosine phosphorylase  46.71 
 
 
287 aa  275  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1656  methylthioadenosine phosphorylase  53.66 
 
 
287 aa  275  8e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.339163  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2021  methylthioadenosine phosphorylase  49.48 
 
 
287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6331  methylthioadenosine phosphorylase  48.46 
 
 
293 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4009  methylthioadenosine phosphorylase  47.95 
 
 
290 aa  271  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4047  methylthioadenosine phosphorylase  47.95 
 
 
290 aa  271  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1392  methylthioadenosine phosphorylase  52.84 
 
 
302 aa  270  2e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2557  methylthioadenosine phosphorylase  52.85 
 
 
287 aa  269  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01985e-31 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2582  methylthioadenosine phosphorylase  50.56 
 
 
275 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1576  methylthioadenosine phosphorylase  49.06 
 
 
290 aa  267  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3686  5'-methylthioadenosine phosphorylase  47.78 
 
 
290 aa  265  5.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3607  methylthioadenosine phosphorylase  52.52 
 
 
284 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25331  5'-methylthioadenosine phosphorylase  51.25 
 
 
304 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1666  methylthioadenosine phosphorylase  47.14 
 
 
303 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.307895  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03801  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.48 
 
 
310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.155061 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1096  methylthioadenosine phosphorylase  49.82 
 
 
303 aa  258  7e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152952  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1155  methylthioadenosine phosphorylase  47.89 
 
 
297 aa  256  4e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03241  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.93 
 
 
297 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1474  methylthioadenosine phosphorylase  51.5 
 
 
298 aa  252  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244682  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0431  methylthioadenosine phosphorylase  52.05 
 
 
287 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03251  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.93 
 
 
297 aa  252  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4909  methylthioadenosine phosphorylase  49.82 
 
 
286 aa  252  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000657789  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0303  methylthioadenosine phosphorylase  48.57 
 
 
297 aa  251  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388658  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03341  5'-methylthioadenosine phosphorylase  49.3 
 
 
299 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3664  methylthioadenosine phosphorylase  51.5 
 
 
298 aa  248  7e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3476  methylthioadenosine phosphorylase  45.8 
 
 
301 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03271  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.34 
 
 
316 aa  245  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0365  methylthioadenosine phosphorylase  47.89 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_458  methylthioadenosine phosphorylase  42.96 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0517  methylthioadenosine phosphorylase  42.61 
 
 
294 aa  242  5e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0493  methylthioadenosine phosphorylase  47.88 
 
 
294 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2590  methylthioadenosine phosphorylase  43.87 
 
 
286 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  45.22 
 
 
270 aa  219  6e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  43.61 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0422  methylthioadenosine phosphorylase  43.97 
 
 
296 aa  215  5e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.200646 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  43.09 
 
 
263 aa  210  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  44.49 
 
 
269 aa  206  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  44.35 
 
 
257 aa  206  5e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01530  glutamate biosynthesis-related protein, putative  42.09 
 
 
303 aa  204  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2618  methylthioadenosine phosphorylase  43.09 
 
 
249 aa  203  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1180  methylthioadenosine phosphorylase  43.24 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2786  methylthioadenosine phosphorylase  42.91 
 
 
293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2691  methylthioadenosine phosphorylase  42.91 
 
 
293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1782  methylthioadenosine phosphorylase  43.51 
 
 
244 aa  195  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  43.32 
 
 
280 aa  194  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  43.72 
 
 
280 aa  194  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  42.91 
 
 
280 aa  192  6e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10230  5'-methylthioadenosine phosphorylase (Meu1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08720)  43.13 
 
 
355 aa  187  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0600587  normal  0.0456068 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0622  methylthioadenosine phosphorylase  41.18 
 
 
268 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65182  predicted protein  43.94 
 
 
332 aa  186  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.306629 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  43.2 
 
 
286 aa  186  4e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3381  methylthioadenosine phosphorylase  47.01 
 
 
292 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0435  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  42.52 
 
 
280 aa  182  6e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0928  methylthioadenosine phosphorylase  41.94 
 
 
263 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.563621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0963  methylthioadenosine phosphorylase  43.1 
 
 
268 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1647  methylthioadenosine phosphorylase  42.92 
 
 
265 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0904  methylthioadenosine phosphorylase  43.08 
 
 
279 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.97 
 
 
267 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2924  methylthioadenosine phosphorylase  41.06 
 
 
263 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  39.18 
 
 
257 aa  175  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.7 
 
 
263 aa  175  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279888  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3192  methylthioadenosine phosphorylase  42.98 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2065  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.83 
 
 
263 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0647  methylthioadenosine phosphorylase  45.15 
 
 
292 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.161691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0705  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.92 
 
 
260 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.74 
 
 
267 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1396  methylthioadenosine phosphorylase  41.75 
 
 
255 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1259  purine phosphorylase family 2  37.5 
 
 
243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>