27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4981 on replicon NC_010683
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010683  Rpic_4981  TnsA endonuclease  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0242609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2525  TnsA endonuclease  99.07 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2937  TnsA endonuclease  76.74 
 
 		 215 aa  338  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1679  TnsA endonuclease  76.74 
 
 		 215 aa  338  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1581  TnsA endonuclease  79.07 
 
 		 214 aa  325  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0142354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3933  hypothetical protein  50.34 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  39.62 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  36.59 
 
 		 217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  30.28 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0186  urease, gamma subunit region  33.49 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2506  transposon transposase protein A, putative  34.72 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2137  TnsA endonuclease  34.72 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0160044 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  32.58 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0059  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  23.98 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  23.98 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  31.02 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  31.02 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  31.02 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  31.02 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  26.21 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0221  TnsA endonuclease  29.3 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136583  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3223  hypothetical protein  26.16 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.384792  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  24.19 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  26.83 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0614  hypothetical protein  27.49 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2434  hypothetical protein  29.76 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0993046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>