66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2873 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2873  putative thioredoxin protein  100 
 
 		 141 aa  288  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2467  putative thioredoxin protein  91.49 
 
 		 141 aa  228  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2638  putative thioredoxin protein  77.14 
 
 		 140 aa  201  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.566673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1041  putative thioredoxin protein  70.59 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1005  putative thioredoxin protein  74.19 
 
 		 134 aa  196  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3962  putative thioredoxin protein  67.48 
 
 		 148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2498  putative thioredoxin protein  61.79 
 
 		 143 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0668  hypothetical protein  68.14 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3838  hypothetical protein  65.83 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0645  hypothetical protein  67.26 
 
 		 146 aa  167  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1307  hypothetical protein  66.07 
 
 		 143 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2634  hypothetical protein  68.27 
 
 		 139 aa  160  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0720  hypothetical protein  69.23 
 
 		 152 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0267  hypothetical protein  67.31 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0751  hypothetical protein  67.31 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3312  thioredoxin family protein  70.41 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3323  hypothetical protein  70.41 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2207  hypothetical protein  70.41 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2327  hypothetical protein  70.41 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3279  thioredoxin family protein  70.41 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0785061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0499  hypothetical protein  70.41 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820534  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1100  hypothetical protein  70.41 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  27.45 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  26.73 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  35.21 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  27.72 
 
 		 269 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  28.87 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  25 
 
 		 241 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  30.77 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  32.94 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1660  Thioredoxin domain protein  28.83 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  28.43 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  25.81 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  28.43 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2654  thioredoxin-related protein  32.5 
 
 		 370 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.540425 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  30.68 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  32.94 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  30.26 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0859  Thioredoxin domain protein  22.64 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827766  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  27.47 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  26.92 
 
 		 406 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  25 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  26.67 
 
 		 110 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  29.21 
 
 		 146 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  26.51 
 
 		 104 aa  42  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  29.07 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  28.43 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4889  Thioredoxin domain protein  23.58 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3383  Thioredoxin domain protein  29.9 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.346342  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0493  uroporphyrinogen-III synthase  25 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  30 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  26.36 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  26.67 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  26.67 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0794  Thioredoxin domain protein  27.27 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  29.21 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  28.12 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4209  thioredoxin  30.59 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  29.17 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  28.26 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  30.34 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  30.53 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  28.26 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  24.51 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  27.56 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  29.29 
 
 		 111 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>