32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0204 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0204  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  736    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  35.36 
 
 		 342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  34.43 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  33.51 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  32.82 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  36.46 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1682  hypothetical protein  36.56 
 
 		 353 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2934  hypothetical protein  36.56 
 
 		 353 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  34.81 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  36.36 
 
 		 344 aa  97.1  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  35 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  31.22 
 
 		 366 aa  87  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  35.77 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  30.73 
 
 		 306 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  26.01 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  26.01 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  21.3 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  48.84 
 
 		 568 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2173  hypothetical protein  30.05 
 
 		 497 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2646  hypothetical protein  30.05 
 
 		 497 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  36.9 
 
 		 425 aa  49.7  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1348  hypothetical protein  30.05 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1224  hypothetical protein  30.05 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1857  hypothetical protein  27.32 
 
 		 504 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  27.44 
 
 		 569 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5415  hypothetical protein  43.14 
 
 		 849 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590405  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0030  hypothetical protein  31.87 
 
 		 628 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5593  hypothetical protein  43.14 
 
 		 849 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3570  hypothetical protein  30.59 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3573  hypothetical protein  34.52 
 
 		 664 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0309383 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  27.78 
 
 		 410 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  30.12 
 
 		 410 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>