110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1291 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1291  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  283  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4168  hypothetical protein  90.14 
 
 		 142 aa  262  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4270  hypothetical protein  85.82 
 
 		 141 aa  253  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.372249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4804  hypothetical protein  82.27 
 
 		 141 aa  233  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6907  hypothetical protein  62.5 
 
 		 139 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2885  hypothetical protein  44.2 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2661  hypothetical protein  43.48 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2855  hypothetical protein  43.48 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.266671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2860  hypothetical protein  43.48 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00728659 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2582  hypothetical protein  42.03 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2902  hypothetical protein  42.03 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  36.5 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  34.85 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  34.06 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  35.16 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  27.66 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  32.03 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  30.43 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1469  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0427929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  30.15 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  32.74 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  33.63 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  29.73 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  28.99 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2390  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.01 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  27.34 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  31.13 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  29.46 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  33.09 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  32.59 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  32.59 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  32.59 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  32.59 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  30.37 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  30.91 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  32.59 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4191  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.63 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  32.59 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  32.59 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  33.93 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  29.32 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  32.11 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  30.53 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  32.35 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  32.46 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  30.83 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  32.14 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  32.14 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  32.14 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  32.14 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  32.14 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  32.14 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1634  cytidine deaminase  30.63 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.574132  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  27.41 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  30.91 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  32.73 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  32.73 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  32.73 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0740  cytidine deaminase  32.11 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  31.82 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  26.12 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  31.86 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  27.52 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1838  cytidine deaminase  35.78 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  27.27 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  29.46 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  28.91 
 
 		 388 aa  47.4  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  26.15 
 
 		 138 aa  47.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  25.19 
 
 		 132 aa  47.4  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  28.37 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  29.09 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  28.36 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0733  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  24.35 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00269425 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  33.94 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0498  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  24.35 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.115067 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5437  hypothetical protein  36.45 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  25.37 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  32.73 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1459  cytidine deaminase  29.63 
 
 		 396 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  26.55 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2761  cytidine deaminase  31.82 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1137  cytidine deaminase  28.15 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000157258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  27.01 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  27.74 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  27.27 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0998  cytidine deaminase  30.56 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349207  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1386  cytidine deaminase  30.23 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67349  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2140  cytidine deaminase  26.13 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.621603  normal  0.187784 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  24.55 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2867  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.25 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  25.9 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1065  cytidine deaminase  30.84 
 
 		 135 aa  42.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.805536  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  30.15 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  27.27 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  32.11 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1316  cytidine deaminase  27.46 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.501646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.25 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>