71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0359 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0359  HPr kinase  100 
 
 		 155 aa  296  6e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  67.35 
 
 		 153 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0465  HPr kinase  70.71 
 
 		 175 aa  190  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0595  HPr kinase  64.67 
 
 		 180 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0343578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0441  HPr kinase  62.59 
 
 		 168 aa  174  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7369  HPr kinase  62.94 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0346  hypothetical protein  60.71 
 
 		 169 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.26045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2847  HPr kinase  51.39 
 
 		 149 aa  123  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1398  HPr kinase  53.85 
 
 		 179 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1177  HPr kinase  51.54 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1236  HPr kinase  50 
 
 		 175 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5435  HPr kinase  46.96 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142999  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0253  HPr kinase  43.64 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0460144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  38.52 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  40.71 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  38.89 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0046  hypothetical protein  36.09 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3250  HPr kinase  33.57 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  39.82 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  36.36 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  40 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0113  HPr kinase  40.46 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3967  HPr kinase  32.37 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2739  HPr kinase  36.43 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.192127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4294  HPr kinase  31.13 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  37.5 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  34.71 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3449  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  39.17 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3573  HPr kinase  38.84 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0777  HPr kinase/phosphorylase  28 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  38.4 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3087  HPr kinase  35.81 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  37.5 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0447  HPr kinase  38.1 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0563  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  28.76 
 
 		 319 aa  48.9  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0597  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  32.08 
 
 		 321 aa  47.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  36.07 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  41.25 
 
 		 320 aa  47  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0210  HPr kinase/phosphorylase  36.54 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  33.09 
 
 		 311 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  37.14 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl062  HPr kinase/phosphorylase  24.5 
 
 		 310 aa  45.8  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  25.55 
 
 		 308 aa  44.7  0.0005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0719  HPr kinase/phosphorylase  28.67 
 
 		 309 aa  44.7  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  32.5 
 
 		 311 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  29.58 
 
 		 319 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0144  HPr kinase/phosphorylase  29.68 
 
 		 319 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.840136 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0260  HPr kinase/phosphorylase  29.49 
 
 		 324 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0287  HPr kinase/phosphorylase  29.49 
 
 		 324 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811002  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0405  HPr kinase/phosphorylase  29.49 
 
 		 324 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0299  HPr kinase/phosphorylase  30.13 
 
 		 323 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0705  HPr kinase/phosphorylase  31.41 
 
 		 315 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.447864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0352  HPr kinase/phosphorylase  30.13 
 
 		 323 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5282  HPr kinase/phosphorylase  28.99 
 
 		 309 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  28.99 
 
 		 309 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5267  HPr kinase/phosphorylase  28.99 
 
 		 309 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  28.99 
 
 		 309 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0638  HPr kinase/phosphorylase  27.81 
 
 		 310 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5392  HPr kinase/phosphorylase  28.99 
 
 		 309 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4856  HPr kinase/phosphorylase  28.99 
 
 		 309 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4841  HPr kinase/phosphorylase  28.99 
 
 		 309 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  28.99 
 
 		 309 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2164  HPr kinase/phosphorylase  29.17 
 
 		 319 aa  41.2  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1208  HPr kinase/phosphorylase  28.39 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0757  HPr kinase/phosphorylase  28.39 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.825604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16040  HPr kinase  29.2 
 
 		 308 aa  41.2  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0124  HPr kinase  34.18 
 
 		 330 aa  40.4  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000598829 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3706  HPr kinase/phosphorylase  29.71 
 
 		 309 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2617  HPr kinase  27.52 
 
 		 605 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00751304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  28.99 
 
 		 309 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0566  HPr kinase/phosphorylase  28.97 
 
 		 322 aa  40.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>