30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4118 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1307  hypothetical protein  82.22 
 
 		 388 aa  660    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4118  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  828    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4088  hypothetical protein  34.02 
 
 		 388 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.313478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3832  hypothetical protein  32.31 
 
 		 387 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1775  hypothetical protein  29.72 
 
 		 389 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2216  hypothetical protein  30.08 
 
 		 388 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6492  hypothetical protein  24.75 
 
 		 485 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1846  putative cytoplasmic protein  26.77 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1513  hypothetical protein  26.42 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.185934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0912  hypothetical protein  27.86 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0522932  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  27.25 
 
 		 371 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4077  hypothetical protein  27.6 
 
 		 372 aa  126  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  27.17 
 
 		 381 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3834  hypothetical protein  26.7 
 
 		 383 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.221085  normal  0.0370464 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0150  hypothetical protein  26.24 
 
 		 381 aa  99.8  9e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000318302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0109  hypothetical protein  24.68 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00220  hypothetical protein  29.19 
 
 		 371 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1169  hypothetical protein  24.16 
 
 		 373 aa  92.8  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0945057 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2164  hypothetical protein  25.78 
 
 		 387 aa  89.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1786  hypothetical protein  23.74 
 
 		 383 aa  87.4  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2092  hypothetical protein  26.15 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1718  hypothetical protein  25.26 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.473614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3034  hypothetical protein  23.8 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2239  hypothetical protein  22.47 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4255  hypothetical protein  26.65 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2060  hypothetical protein  21.73 
 
 		 361 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4277  hypothetical protein  26.4 
 
 		 365 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4124  hypothetical protein  26.63 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173998  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1100  hypothetical protein  23.9 
 
 		 364 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1812  hypothetical protein  26.4 
 
 		 374 aa  47  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>