More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3870 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3870  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 257 aa  528  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0202  glycosyl transferase family protein  92.58 
 
 		 257 aa  498  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1895  glycosyl transferase family 2  84.58 
 
 		 252 aa  428  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  73.66 
 
 		 254 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  36.09 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1658  glycosyl transferase family 2  38.42 
 
 		 278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 		 235 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 		 319 aa  128  9.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2963  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 		 787 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0080512  hitchhiker  0.000919293 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 320 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 324 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  31.78 
 
 		 328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  31.54 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4403  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.486118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1143  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.290738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 334 aa  108  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 320 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  28.17 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 		 325 aa  105  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 314 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 342 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 		 314 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.3 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 320 aa  102  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 		 314 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 		 336 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 568 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  27.11 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 		 331 aa  101  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 343 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.25 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3516  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 		 230 aa  99.4  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.48 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 		 323 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 		 234 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.53 
 
 		 316 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 318 aa  96.3  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 		 329 aa  96.3  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 324 aa  96.3  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 249 aa  95.5  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 343 aa  95.5  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  28.29 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.11 
 
 		 322 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 316 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3919  putative undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.8 
 
 		 245 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 		 230 aa  93.2  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.64 
 
 		 322 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3351  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 434 aa  92.4  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0805099  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 329 aa  92.4  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 		 240 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 337 aa  92  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  32.3 
 
 		 318 aa  92  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  28.64 
 
 		 322 aa  92  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 322 aa  92  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.64 
 
 		 322 aa  92  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.64 
 
 		 322 aa  92  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.64 
 
 		 322 aa  92  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  28.64 
 
 		 322 aa  92  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4177  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 432 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 		 312 aa  91.3  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 		 337 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  26.14 
 
 		 347 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2075  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 374 aa  91.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 		 312 aa  91.3  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02925  dolichol-phosphate mannosyltransferase  27.95 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.3 
 
 		 327 aa  90.5  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3863  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.64 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 		 312 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.64 
 
 		 327 aa  89.7  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 586 aa  89.7  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1532  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.196809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.17 
 
 		 327 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>