45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3688 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3688  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  159  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148975  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  62.32 
 
 		 69 aa  93.6  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0554  hypothetical protein  62.32 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0248  hypothetical protein  67.19 
 
 		 64 aa  90.5  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.209106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  60.56 
 
 		 72 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  53.73 
 
 		 72 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1176  protein of unknown function UPF0150  57.89 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  48.53 
 
 		 73 aa  67  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1504  hypothetical protein  38.89 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00554822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1511  hypothetical protein  38.89 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1441  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0633487  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1470  hypothetical protein  38.89 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1463  hypothetical protein  38.89 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  45.45 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  42 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  40.91 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  40.91 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  38.89 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2670  protein of unknown function UPF0150  39.39 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158684 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  37.7 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  37.7 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  42 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  41.1 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  44 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  41.67 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  41.67 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  39.29 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  37.93 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  42.22 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  34.48 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0981  protein of unknown function UPF0150  34.72 
 
 		 73 aa  44.3  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000496376  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  34.48 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  35.19 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  35.19 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  38 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  32.31 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  43.48 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  38.64 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  42 
 
 		 74 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  43.64 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  43.64 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  43.48 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>