24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3152 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3152  O-antigen polymerase  100 
 
 		 546 aa  1078    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2975  O-antigen polymerase  66.42 
 
 		 549 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.024758  decreased coverage  0.00000748304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  27.89 
 
 		 461 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  26.97 
 
 		 402 aa  55.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  26.99 
 
 		 754 aa  54.7  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  28.46 
 
 		 457 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  28.46 
 
 		 457 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  25 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  22.22 
 
 		 433 aa  47.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0065  O-antigen polymerase  28.47 
 
 		 502 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6500  O-antigen polymerase  26.42 
 
 		 794 aa  47.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3309  hypothetical protein  29.45 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1664  O-antigen polymerase  26.42 
 
 		 806 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  25.9 
 
 		 470 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  26.4 
 
 		 467 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  22.7 
 
 		 452 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3537  membrane protein PslJ  29.21 
 
 		 471 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0975897  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4099  O-antigen ligase  28.71 
 
 		 404 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2436  O-antigen polymerase  29.81 
 
 		 894 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3931  O-antigen ligase  28.22 
 
 		 404 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  23.81 
 
 		 845 aa  44.3  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3912  O-antigen ligase  28.22 
 
 		 404 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0464096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4038  O-antigen ligase  28.22 
 
 		 404 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  28.64 
 
 		 497 aa  43.9  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>