242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2214 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3363  phosphoserine aminotransferase  86.98 
 
 
361 aa  654    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2214  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 
361 aa  742    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.277 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2443  phosphoserine aminotransferase  66.57 
 
 
360 aa  481  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1719  phosphoserine aminotransferase  59.33 
 
 
360 aa  461  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0638  phosphoserine aminotransferase  60.17 
 
 
360 aa  448  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1454  phosphoserine aminotransferase  60.45 
 
 
362 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1232  phosphoserine aminotransferase  60.11 
 
 
358 aa  429  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3221  phosphoserine aminotransferase  56.67 
 
 
361 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2173  phosphoserine aminotransferase  60.06 
 
 
372 aa  414  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2083  phosphoserine aminotransferase  56.11 
 
 
360 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  52.91 
 
 
361 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2987  phosphoserine aminotransferase  49.44 
 
 
360 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  52.65 
 
 
362 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  50.69 
 
 
360 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  52.1 
 
 
361 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  52.65 
 
 
362 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1744  phosphoserine aminotransferase  51.25 
 
 
360 aa  376  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  53.5 
 
 
361 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  49.72 
 
 
360 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  49.44 
 
 
360 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  52.49 
 
 
360 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  51.25 
 
 
360 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  49.17 
 
 
360 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  52.38 
 
 
361 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  49.17 
 
 
360 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  52.21 
 
 
360 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  50.56 
 
 
360 aa  371  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  51.4 
 
 
363 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  49.44 
 
 
360 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  50.83 
 
 
360 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  51.97 
 
 
361 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  49.44 
 
 
360 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  51.82 
 
 
361 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  51.8 
 
 
359 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  51.54 
 
 
361 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  48.89 
 
 
360 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  50.28 
 
 
361 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  50.42 
 
 
359 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2622  phosphoserine aminotransferase  51.2 
 
 
375 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.699254  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  51.54 
 
 
395 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  49.31 
 
 
360 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2708  phosphoserine aminotransferase  51.07 
 
 
375 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2803  phosphoserine aminotransferase  51.07 
 
 
375 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128725  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1719  phosphoserine aminotransferase  49.73 
 
 
375 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.442694 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3079  phosphoserine aminotransferase  48.89 
 
 
360 aa  362  4e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3321  phosphoserine aminotransferase  48.89 
 
 
360 aa  362  4e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2540  phosphoserine aminotransferase  50.14 
 
 
361 aa  362  6e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455506  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2167  phosphoserine aminotransferase  51.93 
 
 
377 aa  362  6e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  51.82 
 
 
361 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  49.17 
 
 
359 aa  362  7.0000000000000005e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2469  phosphoserine aminotransferase  48.34 
 
 
361 aa  360  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302224  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  50.42 
 
 
360 aa  360  3e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2086  phosphoserine aminotransferase  48.03 
 
 
360 aa  359  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000931144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0735  phosphoserine aminotransferase  50.68 
 
 
364 aa  358  7e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000198961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  47.65 
 
 
387 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  48.77 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1338  phosphoserine aminotransferase  49.04 
 
 
363 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.175355  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  49.86 
 
 
361 aa  355  8.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2859  phosphoserine aminotransferase  49.31 
 
 
359 aa  352  4e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257714  hitchhiker  0.0000000029083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  47.09 
 
 
360 aa  352  5e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1676  phosphoserine aminotransferase  47.25 
 
 
359 aa  347  1e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0740  phosphoserine aminotransferase  48.18 
 
 
360 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1599  phosphoserine aminotransferase  48.35 
 
 
359 aa  347  2e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.534688  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1359  phosphoserine aminotransferase  51.8 
 
 
335 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416954  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  48.06 
 
 
373 aa  345  5e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12357  predicted protein  48.47 
 
 
394 aa  345  6e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169231  normal  0.290006 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  47.77 
 
 
362 aa  345  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0348  phosphoserine aminotransferase  48.02 
 
 
358 aa  345  1e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  47.09 
 
 
362 aa  344  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0922  phosphoserine aminotransferase  48.46 
 
 
360 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00717  phosphoserine aminotransferase  48.48 
 
 
361 aa  342  4e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0191898  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1632  phosphoserine aminotransferase  47.18 
 
 
358 aa  342  5.999999999999999e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0918  phosphoserine aminotransferase  48.46 
 
 
360 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2342  phosphoserine aminotransferase  48.34 
 
 
361 aa  341  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0172943  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1375  phosphoserine aminotransferase  50.89 
 
 
335 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  47.27 
 
 
365 aa  341  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0371  phosphoserine aminotransferase  47.74 
 
 
358 aa  340  2e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  47.5 
 
 
369 aa  340  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2332  phosphoserine aminotransferase  46.54 
 
 
361 aa  339  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4155  phosphoserine aminotransferase  47.62 
 
 
360 aa  339  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1192  phosphoserine aminotransferase  45.74 
 
 
354 aa  339  5e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3007  phosphoserine aminotransferase  46.93 
 
 
360 aa  338  9e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.0187233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0903  phosphoserine aminotransferase  48.34 
 
 
378 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1538  phosphoserine aminotransferase  46.96 
 
 
360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0905864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1001  phosphoserine aminotransferase  47.34 
 
 
360 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0639  phosphoserine aminotransferase  46.96 
 
 
360 aa  335  5.999999999999999e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0563  phosphoserine aminotransferase  47.34 
 
 
360 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1489  phosphoserine aminotransferase  48.08 
 
 
364 aa  334  1e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0105187  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1042  phosphoserine aminotransferase  47.34 
 
 
360 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943212  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1115  phosphoserine aminotransferase  46.09 
 
 
362 aa  334  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.27291 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1952  phosphoserine aminotransferase  46.96 
 
 
361 aa  334  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000132565  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2262  phosphoserine aminotransferase  47.62 
 
 
360 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.022425  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0976  phosphoserine aminotransferase  46.65 
 
 
360 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33803  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1706  phosphoserine aminotransferase  46.41 
 
 
361 aa  332  5e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000174531  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2671  phosphoserine aminotransferase  46.69 
 
 
361 aa  332  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.146724  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2583  phosphoserine aminotransferase  46.69 
 
 
361 aa  332  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00074187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2886  phosphoserine aminotransferase  46.5 
 
 
360 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2949  phosphoserine aminotransferase  46.5 
 
 
360 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0197  phosphoserine aminotransferase  46.5 
 
 
360 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1401  phosphoserine aminotransferase  47.62 
 
 
364 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>