220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1565 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1565  peptidase A24A domain-containing protein  100 
 
 		 254 aa  491  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3416  peptidase A24A domain-containing protein  84.65 
 
 		 254 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1839  peptidase A24A domain protein  50 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.639181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4469  peptidase A24A prepilin type IV  41.88 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  27.78 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  29.8 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.08 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.49 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  30.99 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  26.27 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  29.24 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  32.23 
 
 		 258 aa  91.7  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  27.67 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.64 
 
 		 281 aa  89.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  26.88 
 
 		 274 aa  85.5  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  30.45 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0501  peptidase A24A domain-containing protein  28.68 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  25.79 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  28.74 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06881  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  26.05 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1138  peptidase A24A domain-containing protein  26.36 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120004  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  29.37 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0992  peptidase A24A domain-containing protein  26.12 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0044171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0244  peptidase A24A domain protein  25.83 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0971  peptidase A24 N- domain-containing protein  28 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  27.92 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.76 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  26.91 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  30.67 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.1 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  25 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  29.37 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  28.4 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  23.64 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  24.03 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  28.77 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  28.77 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  25.94 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  26.1 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  27.11 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  25.1 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  32.12 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  28.75 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  28.77 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  28.3 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.11 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  27.31 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  27.2 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  27.21 
 
 		 286 aa  72  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  22.53 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  26.98 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  26.84 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  27.91 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  31.85 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  27.36 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  31.39 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.91 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  26.12 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1309  Prepilin peptidase  29.36 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  26.57 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.91 
 
 		 308 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  25.58 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  26.97 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.08 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  27.44 
 
 		 308 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0671  peptidase A24A domain protein  29.25 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1037  peptidase A24A domain protein  30.05 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.869777 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  28.68 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  25.94 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  29.92 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  28.05 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  28.63 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.4 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  28.52 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  26.2 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0996  peptidase A24A-like  22.83 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0671  peptidase A24A domain protein  29.25 
 
 		 299 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1391  prepilin peptidase  26.95 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.77 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1186  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  27.17 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262365  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0067  prepilin peptidase  30.67 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000398253  normal  0.330687 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0149  peptidase A24A domain-containing protein  28.12 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1264  peptidase A24 N- domain-containing protein  34.57 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0142406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.52 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  27.94 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3141  type IV prepilin peptidase family protein  28.74 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3250  leader peptidase PppA  28.74 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  22.43 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  24.62 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  29.44 
 
 		 287 aa  62  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.204549 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0724  Acid phosphatase  27.8 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0637  prepilin peptidase  28.97 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  29.2 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  29.2 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  26.77 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  26.74 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  28.11 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0963  type IV prepilin peptidase  22.26 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3259  prepilin peptidase  22.26 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000482568  hitchhiker  0.0000000000000925794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>