More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1034 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1034  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 117 aa  229  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1436  50S ribosomal protein L20  94.02 
 
 		 117 aa  193  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 118 aa  158  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  66.09 
 
 		 117 aa  155  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  69.37 
 
 		 119 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  69.37 
 
 		 119 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 117 aa  152  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  65.81 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  62.93 
 
 		 117 aa  151  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  61.54 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  65.81 
 
 		 117 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  61.74 
 
 		 118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 119 aa  151  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 118 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 118 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 118 aa  150  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 118 aa  150  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  64.96 
 
 		 117 aa  150  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 117 aa  150  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  150  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  58.12 
 
 		 117 aa  150  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3161  50S ribosomal protein L20  74.36 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0331721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  63.96 
 
 		 116 aa  148  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  148  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  63.16 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  63.16 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  147  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 119 aa  147  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  63.16 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  63.16 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4638  50S ribosomal protein L20  71.79 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000337844  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  147  5e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 119 aa  147  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  147  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  62.61 
 
 		 121 aa  147  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  147  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  147  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 125 aa  147  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 117 aa  147  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  63.16 
 
 		 118 aa  147  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1455  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0200  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00269198  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000821818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0574  50S ribosomal protein L20  60.34 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  60 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  66.06 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  57.26 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 121 aa  144  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 119 aa  143  6e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 121 aa  144  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1757  50S ribosomal protein L20  68.87 
 
 		 117 aa  144  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0134124  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  58.12 
 
 		 117 aa  143  7.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 119 aa  143  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>