More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1032 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 238 aa  483  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  87.56 
 
 		 225 aa  377  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  78.82 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  62.87 
 
 		 219 aa  264  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  55.21 
 
 		 164 aa  204  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  59.17 
 
 		 190 aa  204  8e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  57.83 
 
 		 172 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  53.01 
 
 		 181 aa  202  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  61.49 
 
 		 170 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 202 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  59.63 
 
 		 202 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  49.48 
 
 		 198 aa  198  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  54.82 
 
 		 174 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 		 187 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  53.99 
 
 		 179 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  48.57 
 
 		 357 aa  196  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  52.38 
 
 		 195 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  57.65 
 
 		 173 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  57.65 
 
 		 176 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  55.15 
 
 		 173 aa  195  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  56.89 
 
 		 178 aa  194  7e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  56.29 
 
 		 178 aa  194  9e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  56.47 
 
 		 173 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  56.1 
 
 		 194 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  54.39 
 
 		 195 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  54.39 
 
 		 195 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  54.39 
 
 		 195 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  54.39 
 
 		 195 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  54.39 
 
 		 186 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 		 173 aa  192  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  59.01 
 
 		 190 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 		 166 aa  191  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 		 166 aa  191  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  56.52 
 
 		 166 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  56.52 
 
 		 166 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  56.52 
 
 		 166 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  55.88 
 
 		 173 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  54.88 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  54.88 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  55.09 
 
 		 174 aa  188  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  54.71 
 
 		 173 aa  188  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  55.83 
 
 		 176 aa  187  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  53.05 
 
 		 177 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  52.98 
 
 		 175 aa  187  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  57.62 
 
 		 154 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  53.05 
 
 		 183 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  54.82 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  55.41 
 
 		 173 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  53.05 
 
 		 183 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  53.05 
 
 		 183 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  56.02 
 
 		 175 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  51.96 
 
 		 182 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  54.55 
 
 		 225 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  55.15 
 
 		 171 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  49.2 
 
 		 205 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 		 165 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  53.95 
 
 		 156 aa  185  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  56.02 
 
 		 173 aa  185  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  52.73 
 
 		 178 aa  184  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  50.92 
 
 		 164 aa  184  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  48.47 
 
 		 164 aa  184  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  52.6 
 
 		 178 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  52.47 
 
 		 197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  50.61 
 
 		 171 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  51.23 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  50.57 
 
 		 198 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 182 aa  182  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  52.05 
 
 		 173 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1738  translation initiation factor IF-3  50.77 
 
 		 200 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1772  translation initiation factor IF-3  50.77 
 
 		 200 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000139127  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  50.87 
 
 		 192 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 201 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  52.12 
 
 		 173 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  53.29 
 
 		 169 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  46.57 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  46.57 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  46.57 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  50.56 
 
 		 177 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  54.66 
 
 		 172 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 154 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  52.15 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 		 182 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 173 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  50.57 
 
 		 199 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  51.2 
 
 		 192 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 193 aa  178  7e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  45 
 
 		 243 aa  178  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  50.29 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  49.12 
 
 		 196 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  45 
 
 		 401 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  53.55 
 
 		 155 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  49.11 
 
 		 200 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  47.46 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  49.71 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  47.98 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  49.4 
 
 		 180 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  50.66 
 
 		 154 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  51.83 
 
 		 163 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  43.05 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>