49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0605 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0605  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  819    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389442 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4068  hypothetical protein  63.81 
 
 		 432 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.233618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0557  hypothetical protein  30.5 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1408  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.46 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3232  hypothetical protein  29.56 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000018306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  31.14 
 
 		 642 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  34.12 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.04 
 
 		 610 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  34.34 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  32.8 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  32.32 
 
 		 1066 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4193  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.83 
 
 		 688 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259535  normal  0.164737 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  30.37 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  28.72 
 
 		 862 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.29 
 
 		 682 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  28.31 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  29.09 
 
 		 436 aa  46.6  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1631  WD40 domain-containing protein  28.85 
 
 		 347 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  28.43 
 
 		 1062 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  30.64 
 
 		 1097 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  28.43 
 
 		 1062 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  28.43 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  31.1 
 
 		 1065 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  26.46 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  28.95 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  28.87 
 
 		 1067 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  29.55 
 
 		 1062 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3086  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.66 
 
 		 605 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.243477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  26.71 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.28 
 
 		 670 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  28.95 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  25.91 
 
 		 648 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  29.65 
 
 		 734 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2002  WD40 domain protein beta Propeller  28.22 
 
 		 276 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  27.92 
 
 		 1062 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  28.1 
 
 		 1060 aa  44.3  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  25.9 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  27.65 
 
 		 1138 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02602  transcriptional regulatory protein, C terminal  32.2 
 
 		 772 aa  43.9  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  25.93 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.4 
 
 		 673 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  25.93 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 434 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  27.43 
 
 		 938 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2220  WD40 domain protein beta Propeller  27.34 
 
 		 275 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0661774  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  29.44 
 
 		 1062 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  26.04 
 
 		 1059 aa  43.1  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  30.29 
 
 		 432 aa  43.1  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  28.03 
 
 		 1062 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>