More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0488 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3564  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  80.24 
 
 		 420 aa  719    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0488  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 		 431 aa  885    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2352  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.19 
 
 		 420 aa  674    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0159  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  97.14 
 
 		 420 aa  844    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0766  adenosylhomocysteinase  69.54 
 
 		 421 aa  624  1e-178  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.206287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3662  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.71 
 
 		 426 aa  594  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.253183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0211  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.07 
 
 		 418 aa  580  1e-164  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.38 
 
 		 418 aa  575  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.07 
 
 		 418 aa  555  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_454  S-adenosylhomocysteine hydrolase  63.07 
 
 		 418 aa  557  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000135166  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.83 
 
 		 418 aa  555  1e-157  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.185841  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0524  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.14 
 
 		 421 aa  547  1e-154  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.64 
 
 		 425 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2416  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.88 
 
 		 425 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0847  adenosylhomocysteinase  61.93 
 
 		 425 aa  539  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4402  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.58 
 
 		 428 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000312521  normal  0.874469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.42 
 
 		 425 aa  539  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114233  normal  0.339873 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0793  adenosylhomocysteinase  63.04 
 
 		 413 aa  536  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1765  adenosylhomocysteinase  60.52 
 
 		 425 aa  531  1e-150  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.39 
 
 		 426 aa  534  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892985  normal  0.578524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4381  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.98 
 
 		 429 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3963  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.13 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128582  hitchhiker  0.00348944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4055  adenosylhomocysteinase  60.82 
 
 		 420 aa  525  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4609  adenosylhomocysteinase  58.03 
 
 		 422 aa  511  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1004  adenosylhomocysteinase  59.9 
 
 		 418 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1209  adenosylhomocysteinase  59.08 
 
 		 419 aa  501  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.971819  normal  0.0566863 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1811  adenosylhomocysteinase  58.37 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1666  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.11 
 
 		 439 aa  488  1e-137  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0107908 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3754  adenosylhomocysteinase  57.49 
 
 		 420 aa  485  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0764  adenosylhomocysteinase  57.01 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.812753  normal  0.114058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1099  adenosylhomocysteinase  58.01 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.613377  normal  0.211169 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0673  adenosylhomocysteinase  58.54 
 
 		 418 aa  482  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1393  Adenosylhomocysteinase  58.11 
 
 		 413 aa  478  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2686  adenosylhomocysteinase  57.28 
 
 		 425 aa  479  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.56 
 
 		 421 aa  471  1e-132  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1599  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.63 
 
 		 436 aa  474  1e-132  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.171763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.59 
 
 		 415 aa  472  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0145885  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0357  adenosylhomocysteinase  54.65 
 
 		 422 aa  474  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0167  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.31 
 
 		 415 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.636373 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1735  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.07 
 
 		 415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.9 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3048  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.04 
 
 		 428 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000864527  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0727  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.59 
 
 		 437 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0706  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.63 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.4 
 
 		 437 aa  459  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3251  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.23 
 
 		 411 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1787  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.94 
 
 		 436 aa  459  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000671354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1181  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.07 
 
 		 411 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0516  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.02 
 
 		 442 aa  457  1e-127  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0503497  normal  0.0605456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1200  adenosylhomocysteinase  52.93 
 
 		 414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.51661  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2168  adenosylhomocysteinase  50.97 
 
 		 415 aa  450  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4355  adenosylhomocysteinase  55 
 
 		 419 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506408  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1128  adenosylhomocysteinase  52.07 
 
 		 426 aa  449  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2063  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.56 
 
 		 418 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000172774  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0883  adenosylhomocysteinase  51.82 
 
 		 414 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000768348  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0965  adenosylhomocysteinase  51.58 
 
 		 416 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0360  adenosylhomocysteinase  51.71 
 
 		 417 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0617  adenosylhomocysteinase  54.55 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17500  adenosylhomocysteinase  51.11 
 
 		 414 aa  431  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.778784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1187  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.61 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00223621  normal  0.0169924 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0649  adenosylhomocysteinase  51.82 
 
 		 417 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1547  adenosylhomocysteinase  53.33 
 
 		 403 aa  429  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0753  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.48 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0567  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.08 
 
 		 410 aa  425  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0776  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.74 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0147  adenosylhomocysteinase  50.37 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0905  adenosylhomocysteinase  48.66 
 
 		 413 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.61 
 
 		 425 aa  410  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0756  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.37 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0646  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.11 
 
 		 408 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0468936  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0059  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.12 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00179042 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1484  adenosylhomocysteinase  47.06 
 
 		 415 aa  408  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1849  adenosylhomocysteinase  49.88 
 
 		 427 aa  408  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1411  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.34 
 
 		 408 aa  403  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1035  adenosylhomocysteinase  49.76 
 
 		 411 aa  404  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.980475  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0660  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.12 
 
 		 408 aa  398  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0956  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.39 
 
 		 408 aa  391  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.309777  normal  0.704835 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1765  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.63 
 
 		 399 aa  388  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1467  adenosylhomocysteinase  45.21 
 
 		 408 aa  387  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1485  adenosylhomocysteinase  44.15 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.6 
 
 		 438 aa  368  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0136  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.93 
 
 		 401 aa  368  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.23 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0050  adenosylhomocysteinase  47.29 
 
 		 421 aa  361  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00240  adenosylhomocysteinase, putative  47.23 
 
 		 431 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672849  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.95 
 
 		 416 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.205607  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.31 
 
 		 441 aa  349  5e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.71 
 
 		 430 aa  349  5e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  44.08 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.48 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0964  adenosylhomocysteinase  46.06 
 
 		 413 aa  345  8e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00139525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.58 
 
 		 438 aa  341  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.1 
 
 		 435 aa  340  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.47 
 
 		 422 aa  339  5e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3331  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.95 
 
 		 441 aa  338  8e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.276204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.17 
 
 		 476 aa  338  9e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.36 
 
 		 464 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.3 
 
 		 465 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4338  adenosylhomocysteinase  45.67 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.588356  normal  0.419207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.5 
 
 		 476 aa  332  8e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000792408  hitchhiker  0.0000266691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>