71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3003 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3003  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4038  putative MFS superfamily permease  100 
 
 		 252 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4979  putative MFS superfamily permease  100 
 
 		 252 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.547369 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2507  protein of unknown function DUF347  90.08 
 
 		 252 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944064  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2113  protein of unknown function DUF347  89.68 
 
 		 252 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2299  hypothetical protein  88.1 
 
 		 252 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0166488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3518  protein of unknown function DUF347  90.48 
 
 		 252 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4592  protein of unknown function DUF347  90.48 
 
 		 252 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0689  hypothetical protein  76.1 
 
 		 256 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5041  hypothetical protein  76.59 
 
 		 251 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.737372  normal  0.404949 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0094  protein of unknown function DUF347  68.65 
 
 		 252 aa  358  5e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5325  major facilitator protein family permease  78.35 
 
 		 254 aa  353  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0092  hypothetical protein  68.83 
 
 		 248 aa  351  5e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1876  hypothetical protein  66.27 
 
 		 260 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0571167  unclonable  0.00008342 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3455  hypothetical protein  64.59 
 
 		 262 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.093168  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0999  hypothetical protein  62.26 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1393  hypothetical protein  62.65 
 
 		 262 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3900  hypothetical protein  62.3 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4103  protein of unknown function DUF347  67.47 
 
 		 258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0054  hypothetical protein  61.75 
 
 		 259 aa  279  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0571188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0257  hypothetical protein  60.38 
 
 		 269 aa  268  7e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2752  hypothetical protein  59.62 
 
 		 269 aa  251  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4102  protein of unknown function DUF347  59.47 
 
 		 279 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0766  hypothetical protein  48.98 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1118  hypothetical protein  49.36 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2116  hypothetical protein  49.36 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0963  hypothetical protein  49.36 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387944  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1037  hypothetical protein  49.36 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2246  hypothetical protein  49.36 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0647125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2662  hypothetical protein  49.36 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5567  hypothetical protein  46.31 
 
 		 252 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4412  hypothetical protein  45.93 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0967  hypothetical protein  50.45 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.549462  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2541  hypothetical protein  52.19 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  hitchhiker  0.000000132976 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5848  hypothetical protein  51.23 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.084342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2434  hypothetical protein  52.19 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154358  hitchhiker  0.000000000557872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4460  hypothetical protein  45.06 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0779  hypothetical protein  49.38 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000797521 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1905  hypothetical protein  50.64 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2516  hypothetical protein  50.64 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3405  hypothetical protein  50.89 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3899  hypothetical protein  36.14 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03008  hypothetical protein  40.82 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5017  hypothetical protein  39.35 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.516573  normal  0.101315 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1471  hypothetical protein  37.5 
 
 		 395 aa  155  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000124905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1537  hypothetical protein  40.17 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0492  hypothetical protein  40.17 
 
 		 250 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.91251  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1410  hypothetical protein  40.17 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3080  hypothetical protein  40.17 
 
 		 285 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0661  hypothetical protein  40.17 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1206  hypothetical protein  40.17 
 
 		 296 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2301  hypothetical protein  37.25 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0323626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2371  hypothetical protein  38.43 
 
 		 424 aa  142  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1601  hypothetical protein  35.18 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4981  putative MFS superfamily permease  36.11 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864613  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4036  putative MFS superfamily permease  36.11 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3001  hypothetical protein  36.11 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1967  protein of unknown function DUF347  36.87 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2330  hypothetical protein  36.87 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2739  hypothetical protein  36.63 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00573503  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2505  protein of unknown function DUF347  36.86 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2111  protein of unknown function DUF347  36.44 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2596  hypothetical protein  32.94 
 
 		 254 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8898  protein of unknown function DUF347  36.21 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4100  protein of unknown function DUF347  35.02 
 
 		 258 aa  131  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1548  hypothetical protein  35.16 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4177  hypothetical protein  32.13 
 
 		 319 aa  118  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2655  protein of unknown function DUF347  31.82 
 
 		 263 aa  118  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0483  hypothetical protein  35.64 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0079  hypothetical protein  35.1 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2650  hypothetical protein  53.49 
 
 		 53 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>