70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1730 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1730  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  66.67 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  45.1 
 
 		 55 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  49.02 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  49.02 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  45.83 
 
 		 70 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  45.83 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  45.83 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  42.31 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  49.02 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  41.51 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.68 
 
 		 221 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  46 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  44 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  42 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  39.62 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  37.74 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  40.43 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  40.43 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  38 
 
 		 72 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  38 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  39.13 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  41.18 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  40.43 
 
 		 52 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  38.71 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  43.75 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  38 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  39.66 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  42.55 
 
 		 303 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  35.09 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  41.18 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  40.43 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  44.68 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  41.82 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  42 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  40.43 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2096  hypothetical protein  45.28 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00698872  normal  0.744231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  42.37 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  37.25 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  39.22 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  35.38 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  41.82 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  39.13 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  39.13 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  38.3 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  41.82 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  40.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  35.71 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  39.22 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  40.43 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  34.62 
 
 		 57 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  35.71 
 
 		 74 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  41.18 
 
 		 76 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  45 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  41.82 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  39.22 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  39.58 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  42.55 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1931  putative Fe-S protein  42 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  39.22 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.11 
 
 		 250 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  35.48 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  40.43 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  34.43 
 
 		 61 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 61 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>