More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1688 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1688  enolase  100 
 
 		 427 aa  870    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  71.19 
 
 		 429 aa  622  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  68.31 
 
 		 428 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  69.27 
 
 		 433 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  69.39 
 
 		 430 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  69.27 
 
 		 423 aa  599  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  68.69 
 
 		 430 aa  594  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  67.61 
 
 		 427 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  67.29 
 
 		 431 aa  592  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  68.01 
 
 		 431 aa  591  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  68.01 
 
 		 431 aa  591  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  67.8 
 
 		 437 aa  591  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  69.01 
 
 		 428 aa  588  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  68.08 
 
 		 433 aa  588  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 429 aa  588  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  67.84 
 
 		 428 aa  587  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  67.52 
 
 		 431 aa  584  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  67.61 
 
 		 430 aa  585  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0347  phosphopyruvate hydratase  67.88 
 
 		 437 aa  586  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  67.69 
 
 		 431 aa  584  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  67.85 
 
 		 422 aa  585  1e-166  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  67.29 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  67.29 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  67.29 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  67.52 
 
 		 431 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  68.87 
 
 		 430 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  68.08 
 
 		 424 aa  583  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  67.29 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0186  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 		 437 aa  578  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 430 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3133  enolase  68.4 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00432064  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  68.87 
 
 		 434 aa  580  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5032  enolase  68.08 
 
 		 426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 431 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  64.94 
 
 		 425 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  65.26 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1972  phosphopyruvate hydratase  66.06 
 
 		 437 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0278  phosphopyruvate hydratase  65.6 
 
 		 437 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301795 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0151  enolase  65.25 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  67.52 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  67.29 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  64.88 
 
 		 434 aa  568  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  65.97 
 
 		 431 aa  569  1e-161  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0003  enolase  66.12 
 
 		 422 aa  570  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  64.17 
 
 		 433 aa  568  1e-161  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  65.96 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 		 429 aa  569  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0223  phosphopyruvate hydratase  65.15 
 
 		 437 aa  568  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  67.52 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  64.88 
 
 		 434 aa  568  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  64.65 
 
 		 434 aa  565  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  65.01 
 
 		 428 aa  565  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  65.65 
 
 		 427 aa  564  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  67.29 
 
 		 431 aa  567  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  66.43 
 
 		 426 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  65.88 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  65.03 
 
 		 430 aa  562  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  65.65 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  63.38 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  64.79 
 
 		 427 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 431 aa  558  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05865  enolase  65.27 
 
 		 428 aa  559  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1042  phosphopyruvate hydratase  64.32 
 
 		 428 aa  559  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  63.06 
 
 		 425 aa  560  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 427 aa  561  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 426 aa  560  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  64.08 
 
 		 428 aa  560  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  64.94 
 
 		 426 aa  557  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  66.59 
 
 		 426 aa  557  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  64.79 
 
 		 427 aa  554  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  63.85 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 		 427 aa  557  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  65.18 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  64.45 
 
 		 425 aa  557  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  63.85 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  63.87 
 
 		 432 aa  553  1e-156  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  64.55 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0368  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 430 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  65.65 
 
 		 426 aa  553  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 429 aa  551  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  63 
 
 		 425 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  64.55 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  64.79 
 
 		 429 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  63.62 
 
 		 429 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  64.71 
 
 		 426 aa  548  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  63 
 
 		 425 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  63.49 
 
 		 435 aa  548  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0055  enolase  63.76 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  64.94 
 
 		 426 aa  548  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 429 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  65.41 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  63.62 
 
 		 429 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  63.12 
 
 		 429 aa  547  1e-154  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  64.55 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  61.88 
 
 		 429 aa  545  1e-154  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>