32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1563 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 152 aa  303  6e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  38.18 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  35.09 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  30.83 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  33.66 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  37.61 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  33.96 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  33.06 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  32.79 
 
 		 292 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  25.69 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  30.88 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  26.13 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  40.7 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  33.04 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  38.64 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  37.23 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  31.9 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  28 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  33.59 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  29.7 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  26.79 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  28.7 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  27.62 
 
 		 146 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  28.97 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  28.18 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  29.35 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  31.36 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  27.68 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  27.62 
 
 		 141 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>