More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0086 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0086  voltage-dependent potassium channel, beta subunit  100 
 
 		 332 aa  684    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0838  aldo/keto reductase  63.5 
 
 		 322 aa  434  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3157  putative voltage-gated potassium channel, beta subunit  62.31 
 
 		 323 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.350031 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5541  aldo/keto reductase  60.44 
 
 		 323 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2251  aldo/keto reductase  62.58 
 
 		 323 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2130  aldo/keto reductase  62.58 
 
 		 323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.940949  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0875  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.75 
 
 		 323 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.73472  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1392  aldo/keto reductase  61.37 
 
 		 323 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203744  hitchhiker  0.00446461 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1917  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.44 
 
 		 323 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2039  aldo/keto reductase family oxidoreductase  61.37 
 
 		 323 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1962  aldo/keto reductase  61.06 
 
 		 323 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.575618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1064  aldo/keto reductase  60.44 
 
 		 323 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1620  aldo/keto reductase  57.41 
 
 		 329 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.884834  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2213  aldo/keto reductase  60.44 
 
 		 323 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2237  aldo/keto reductase  60.44 
 
 		 323 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0019  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.75 
 
 		 323 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0600  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.75 
 
 		 323 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0504  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.75 
 
 		 323 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0919  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.75 
 
 		 323 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.146678  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5864  aldo/keto reductase  60.12 
 
 		 323 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1813  aldo/keto reductase  56.17 
 
 		 329 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0383943 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0618  aldo/keto reductase  58.51 
 
 		 319 aa  392  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000265496  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0604  aldo/keto reductase  58.51 
 
 		 319 aa  393  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106884  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0148  aldo/keto reductase  57.89 
 
 		 319 aa  388  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00957933  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4200  aldo/keto reductase  57.01 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3006  aldo/keto reductase  55.83 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.378905 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0809  aldo/keto reductase  55.59 
 
 		 317 aa  369  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03480  Voltage-gated potassium channel beta-2 subunit, putative  54.98 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0255  aldo/keto reductase family oxidoreductase  56.88 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.249154 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00610  VIC potassium ion channel, beta subunit (Eurofung)  54.05 
 
 		 344 aa  362  4e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930439  normal  0.576143 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1455  aldo/keto reductase  55.11 
 
 		 322 aa  359  4e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.138581  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0643  aldo/keto reductase  50.31 
 
 		 323 aa  335  7.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.671834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04673  voltage-gated potassium channel beta subunit  51.88 
 
 		 322 aa  331  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08597  VIC potassium ion channel, beta subunit (Eurofung)  51.95 
 
 		 341 aa  329  5.0000000000000004e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  50.15 
 
 		 316 aa  323  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1791  aldo/keto reductase  51.39 
 
 		 321 aa  321  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1862  voltage-gated potassium channel beta subunit  51.7 
 
 		 321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0782  aldo/keto reductase  50.78 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1687  aldo/keto reductase  47.81 
 
 		 310 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  46.89 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0379  aldo/keto reductase  48.29 
 
 		 314 aa  285  5.999999999999999e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0161187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1360  aldo/keto reductase  50.31 
 
 		 328 aa  285  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2390  aldo/keto reductase  48.05 
 
 		 336 aa  285  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000519885  hitchhiker  0.000458148 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  44.27 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  48.32 
 
 		 332 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  48.77 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.2 
 
 		 332 aa  279  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  47.53 
 
 		 334 aa  275  8e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  46.81 
 
 		 334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1857  aldo/keto reductase  48.46 
 
 		 333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3310  aldo/keto reductase  47.69 
 
 		 332 aa  272  7e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108449  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28620  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  46.69 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3542  aldo/keto reductase  46.32 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  46.3 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2158  aldo/keto reductase  45.4 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2023  aldo/keto reductase  44.92 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0725313  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  46.77 
 
 		 333 aa  265  7e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  46.77 
 
 		 335 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2949  aldo/keto reductase  46.46 
 
 		 336 aa  264  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1879  aldo/keto reductase  45.06 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10590  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  45.71 
 
 		 331 aa  262  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244513 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  43.52 
 
 		 317 aa  261  8e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15540  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  44.62 
 
 		 337 aa  261  8.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11890  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  43.94 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.018283  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2987  aldo/keto reductase  44.17 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3746  aldo/keto reductase  42.94 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3949  aldo/keto reductase  44.71 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3154  aldo/keto reductase  46.01 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3265  aldo/keto reductase  44.79 
 
 		 336 aa  256  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0553  aldo/keto reductase  44.14 
 
 		 324 aa  256  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0539  aldo/keto reductase  44.14 
 
 		 324 aa  256  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2751  aldo/keto family dehydrogenase  42.9 
 
 		 329 aa  256  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178849 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1462  aldo/keto reductase  44.27 
 
 		 333 aa  255  8e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3124  aldo/keto reductase  44.41 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.188754  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1794  aldo/keto reductase  44.41 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.81315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2535  aldo/keto reductase  43.29 
 
 		 329 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00875609  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3351  aldo/keto reductase  44.14 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0869  putative oxidoreductase  41.8 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2071  aldo/keto reductase  42.81 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0765419  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  42.59 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  40.24 
 
 		 315 aa  219  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  37.5 
 
 		 353 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0554  aldo/keto reductase  41.85 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21730  Oxidoreductase aldo/keto reductase family  39.62 
 
 		 347 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  39.4 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  39.4 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1527  aldo/keto reductase  39.25 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.137113  normal  0.101936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4367  putative aldo/keto reductase  39.68 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0355  aldo/keto reductase  38.85 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  38.28 
 
 		 338 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  38.49 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2463  aldo/keto reductase  39.48 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3077  aldo/keto reductase  39.48 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0082  aldo/keto reductase  38.83 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0252  aldo/keto reductase  38.78 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  36.83 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  38.73 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0093  aldo/keto reductase  39.61 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3095  aldo/keto reductase  39.16 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>