24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7226 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_7226  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 187 aa  360  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.22284 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5627  peptidase A24A prepilin type IV  91.98 
 
 		 187 aa  285  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0178766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  31.43 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  31.17 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  34.29 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  39.6 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  30.54 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  30.12 
 
 		 178 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  36.46 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  34.81 
 
 		 274 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  28.57 
 
 		 145 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  31.37 
 
 		 175 aa  45.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  36.6 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  32.48 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  25.6 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  33.06 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  30.77 
 
 		 274 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5256  peptidase A24A prepilin type IV  41.67 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.652465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  24.31 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  32.33 
 
 		 259 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.63 
 
 		 259 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  23.61 
 
 		 247 aa  42  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1980  peptidase A24A prepilin type IV  38.68 
 
 		 142 aa  42  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175431  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  29.81 
 
 		 191 aa  42  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>