51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6182 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6182  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 209 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130047  normal  0.343003 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6361  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase protein  85.58 
 
 		 209 aa  333  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.368915  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0112  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.53 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3953  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.09 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377906  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1524  hypothetical protein  49.41 
 
 		 252 aa  160  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2934  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.26 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.67 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.41 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.81 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3084  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.32 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1287  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  26.32 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0130341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3006  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  26.32 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.36 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.01 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2882  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.39 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156757  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1623  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.65 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.65 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326145  normal  0.231246 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0365  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.74 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.61 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3513  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.66 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0430214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1580  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.27 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12737  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3660  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.42 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.87 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2359  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.91 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.11 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  25.56 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.2 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  31.43 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0840  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.92 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  26.51 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.13 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2696  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.06 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31700  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.06 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1725  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.89 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.54 
 
 		 499 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0010  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.85 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  27.66 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  27.66 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  27.66 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.95 
 
 		 197 aa  42  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1491  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.38 
 
 		 201 aa  42  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01375  hypothetical protein  30.38 
 
 		 201 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01363  predicted inner membrane protein  30.38 
 
 		 201 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  27.06 
 
 		 265 aa  42  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.38 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  26.38 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  31.96 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.68 
 
 		 230 aa  41.6  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2237  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.38 
 
 		 201 aa  41.6  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.38 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464665  hitchhiker  0.000964827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.34 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0182356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>