96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5900 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5900  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  927    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5587  hypothetical protein  58.2 
 
 
465 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0909697  normal  0.0199748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02340  cytochrome P450  40.41 
 
 
445 aa  276  5e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169645  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0607  cytochrome P450  37.63 
 
 
407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00215804  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0629  cytochrome P450  37.63 
 
 
407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0616  cytochrome P450  37.63 
 
 
407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2008  hypothetical protein  38 
 
 
403 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1360  cytochrome P450 monooxygenase  36.76 
 
 
478 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.731473  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2435  cytochrome P450  32.64 
 
 
456 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0411175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3091  cytochrome P450  32.48 
 
 
467 aa  176  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242717  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  26.92 
 
 
458 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  28.87 
 
 
1065 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  30.26 
 
 
1065 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  28.44 
 
 
1065 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  28.44 
 
 
1065 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  28.35 
 
 
1065 aa  63.9  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  28.35 
 
 
1006 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  28.35 
 
 
1065 aa  63.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.61 
 
 
1065 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  28.35 
 
 
1065 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  28.35 
 
 
1065 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  27.13 
 
 
462 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  27.03 
 
 
461 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  27.33 
 
 
461 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  26.29 
 
 
446 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  24.67 
 
 
457 aa  55.8  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  27.44 
 
 
468 aa  54.3  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  27.54 
 
 
462 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7149  P-450 monooxygenase  28.21 
 
 
456 aa  53.9  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.472347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  25.11 
 
 
460 aa  53.5  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4342  Cytochrome P450-like protein  28.18 
 
 
412 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  23.86 
 
 
463 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1972  cytochrome P450  25.29 
 
 
525 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  26.95 
 
 
439 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  23.83 
 
 
447 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  27.68 
 
 
463 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  25.62 
 
 
459 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0711  cytochrome P450  24 
 
 
459 aa  51.6  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  25.68 
 
 
474 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  33.33 
 
 
1074 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  25.62 
 
 
459 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  26.95 
 
 
480 aa  51.2  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  27.33 
 
 
453 aa  51.2  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3634  cytochrome P450  27.36 
 
 
462 aa  50.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  26.25 
 
 
1053 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08350  cytochrome P450  26.94 
 
 
416 aa  50.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  28.91 
 
 
466 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  24.67 
 
 
453 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  25 
 
 
445 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5109  cytochrome P450  28.23 
 
 
1071 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2396  cytochrome P450  27.48 
 
 
449 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570158  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  26.67 
 
 
453 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  26.09 
 
 
453 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  24.29 
 
 
429 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  26.95 
 
 
461 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  24.63 
 
 
462 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  27.27 
 
 
470 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3709  cytochrome P450 CYP110H1  30.83 
 
 
442 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.275139 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  26.95 
 
 
495 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  27.27 
 
 
1075 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3985  cytochrome P450  25.56 
 
 
449 aa  49.3  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  26.32 
 
 
450 aa  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  26.53 
 
 
444 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  22.86 
 
 
452 aa  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  26.19 
 
 
467 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1573  cytochrome P450  25.95 
 
 
408 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  23.08 
 
 
460 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  24.4 
 
 
453 aa  47  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3467  cytochrome P450  29.69 
 
 
1064 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  27.73 
 
 
464 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  23.77 
 
 
471 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  29.84 
 
 
462 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  27.61 
 
 
469 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  24.78 
 
 
1055 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  24.67 
 
 
431 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  24.84 
 
 
489 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  22.88 
 
 
459 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  24.03 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  25.15 
 
 
463 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  25.62 
 
 
452 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  28.14 
 
 
467 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  24.43 
 
 
455 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  25.84 
 
 
450 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  24.6 
 
 
1075 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  25 
 
 
473 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  22.9 
 
 
471 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  27.33 
 
 
465 aa  44.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  24.77 
 
 
463 aa  44.3  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3645  FAD-binding oxidoreductase  26.45 
 
 
1072 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368759  normal  0.294023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  27.61 
 
 
466 aa  43.9  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  26.32 
 
 
453 aa  43.9  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  23.68 
 
 
445 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  25.65 
 
 
457 aa  43.5  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  23.53 
 
 
459 aa  43.1  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11142  cytochrome P450, putative (Eurofung)  30.23 
 
 
549 aa  43.1  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4375  cytochrome P450  31.9 
 
 
464 aa  43.1  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000475823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>