29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2008 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2008  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  781    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02340  cytochrome P450  44.47 
 
 		 445 aa  282  6.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5900  hypothetical protein  37.3 
 
 		 459 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1360  cytochrome P450 monooxygenase  41.23 
 
 		 478 aa  225  9e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.731473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5587  hypothetical protein  35.53 
 
 		 465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0909697  normal  0.0199748 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0616  cytochrome P450  35.73 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0629  cytochrome P450  35.73 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0607  cytochrome P450  35.73 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00215804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2435  cytochrome P450  36.2 
 
 		 456 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0411175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3091  cytochrome P450  31.09 
 
 		 467 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3382  putative cytochrome  34.88 
 
 		 487 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  29.59 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  35.42 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  27.41 
 
 		 1075 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37142  Cytochrome P450 52A3 (CYPLIIA3) (Alkane-inducible P450-ALK1-A) (P450-CM1) (CYP52A3-A) (Cytochrome P-450ALK)  33.65 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09384  cytochrome P450, putative (Eurofung)  30.39 
 
 		 512 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284157  normal  0.464861 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11142  cytochrome P450, putative (Eurofung)  29.91 
 
 		 549 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  30.15 
 
 		 471 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  30.15 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56580  Cytochrome P450 52A6 (CYPLIIA6) (Alkane-inducible P450-ALK3)  28.97 
 
 		 515 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.137821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  26.17 
 
 		 495 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  26.17 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  28.68 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  27.73 
 
 		 1053 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  28.04 
 
 		 430 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  26.09 
 
 		 466 aa  43.5  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  30.77 
 
 		 462 aa  43.1  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06057  cytochrome P450, putative (Eurofung)  26.39 
 
 		 517 aa  43.1  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  28.44 
 
 		 447 aa  43.1  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>