28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5516 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5516  Conjugal transfer TraD family protein  100 
 
 		 71 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184996  normal  0.022587 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5395  conjugal transfer protein TraD  80.28 
 
 		 71 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.457429 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8129  conjugal transfer protein Dtr system  76.06 
 
 		 71 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.201985  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8048  conjugal transfer protein Dtr system  76.06 
 
 		 71 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428769  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7062  conjugal transfer protein TraD  73.24 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.604351  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9187  conjugal transfer protein TraD  81.69 
 
 		 81 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4673  conjugal transfer TraD  68.57 
 
 		 71 aa  94.4  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.353098  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5050  conjugal transfer TraD family protein  78.57 
 
 		 64 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.609822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9590  conjugal transfer protein Dtr system  57.89 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4202  conjugal transfer TraD  77.5 
 
 		 50 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30131  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5001  conjugal transfer TraD family protein  59.32 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.973418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4332  conjugal transfer TraD  56.67 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0147  conjugal transfer TraD  50.77 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0437  conjugal transfer protein traD  47.69 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0171  hypothetical protein  53.49 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0270  conjugal transfer TraD family protein  48.39 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0619355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2655  conjugal transfer TraD family protein  48.39 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3230  conjugal transfer TraD  48.39 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.64635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2274  conjugal transfer TraD  54.9 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.667805  normal  0.112089 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0996  conjugal transfer TraD  46.03 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000550634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4518  conjugal transfer TraD  47.62 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527505 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4224  conjugal transfer TraD  47.69 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0545637  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0185  hypothetical protein  42.37 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0098  conjugal transfer TraD family protein  46.77 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3948  conjugal transfer TraD  46.03 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0440  conjugal transfer TraD family protein  48 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13579  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0648  conjugal transfer TraD family protein  47.37 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5573  Conjugal transfer TraD family protein  41.27 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0258543  normal  0.0242363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>