16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4332 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4332  conjugal transfer TraD  100 
 
 		 97 aa  191  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5001  conjugal transfer TraD family protein  55.56 
 
 		 80 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.973418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4673  conjugal transfer TraD  56.92 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.353098  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9590  conjugal transfer protein Dtr system  51.32 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0648  conjugal transfer TraD family protein  54.1 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8048  conjugal transfer protein Dtr system  55.22 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428769  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8129  conjugal transfer protein Dtr system  55.22 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.201985  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5516  Conjugal transfer TraD family protein  56.67 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184996  normal  0.022587 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7062  conjugal transfer protein TraD  48.61 
 
 		 81 aa  57  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.604351  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5395  conjugal transfer protein TraD  53.73 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.457429 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5050  conjugal transfer TraD family protein  68.29 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.609822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4202  conjugal transfer TraD  65.79 
 
 		 50 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30131  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0147  conjugal transfer TraD  42.67 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9187  conjugal transfer protein TraD  57.89 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2274  conjugal transfer TraD  40.79 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.667805  normal  0.112089 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0185  hypothetical protein  56.25 
 
 		 89 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>