12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_5001 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_5001  conjugal transfer TraD family protein  100 
 
 		 80 aa  157  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.973418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4332  conjugal transfer TraD  55.56 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0648  conjugal transfer TraD family protein  46.84 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5516  Conjugal transfer TraD family protein  59.32 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184996  normal  0.022587 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5395  conjugal transfer protein TraD  50 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.457429 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7062  conjugal transfer protein TraD  50 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.604351  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8048  conjugal transfer protein Dtr system  50 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428769  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8129  conjugal transfer protein Dtr system  50 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.201985  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4673  conjugal transfer TraD  51.67 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.353098  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9590  conjugal transfer protein Dtr system  46.67 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5050  conjugal transfer TraD family protein  42.03 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.609822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9187  conjugal transfer protein TraD  43.33 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>