12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0185 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0185  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  174  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0171  hypothetical protein  61.18 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9590  conjugal transfer protein Dtr system  56.1 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5516  Conjugal transfer TraD family protein  42.37 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184996  normal  0.022587 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5395  conjugal transfer protein TraD  68.75 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.457429 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5050  conjugal transfer TraD family protein  65.62 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.609822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7062  conjugal transfer protein TraD  38.36 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.604351  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4202  conjugal transfer TraD  55.56 
 
 		 50 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30131  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8048  conjugal transfer protein Dtr system  65.62 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428769  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8129  conjugal transfer protein Dtr system  65.62 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.201985  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4673  conjugal transfer TraD  46.3 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.353098  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4332  conjugal transfer TraD  56.25 
 
 		 97 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>