More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5312 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5312  inner-membrane translocator  100 
 
 		 342 aa  669    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4617  Monosaccharide-transporting ATPase  90.35 
 
 		 343 aa  580  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3637  monosaccharide-transporting ATPase  78.92 
 
 		 333 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3561  monosaccharide-transporting ATPase  66.03 
 
 		 337 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0784  monosaccharide-transporting ATPase  51.19 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0388  sugar ABC transporter, permease protein  44.88 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0394  sugar ABC transporter, permease protein  44.88 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0347  sugar ABC transporter, permease protein  44.88 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3722  inner-membrane translocator  45.36 
 
 		 329 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0032  sugar ABC transporter, permease  41.95 
 
 		 324 aa  243  5e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.81353  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0929  carbohydrate ABC transporter permease  45.21 
 
 		 329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.306696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3400  monosaccharide-transporting ATPase  45.21 
 
 		 329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3267  carbohydrate ABC transporter permease  44.88 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4695  monosaccharide-transporting ATPase  41.56 
 
 		 329 aa  209  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0366  carbohydrate ABC transporter permease  40.44 
 
 		 329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0433  monosaccharide-transporting ATPase  40.44 
 
 		 329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1229  sugar ABC transporter permease  37.93 
 
 		 314 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.446632 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3353  hypothetical protein  36.31 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108154 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4659  monosaccharide-transporting ATPase  37.18 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225069  normal  0.765727 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3734  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.87 
 
 		 325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.450327  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3467  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2841  monosaccharide-transporting ATPase  35.67 
 
 		 325 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5190  Monosaccharide-transporting ATPase  37.3 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.05 
 
 		 310 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  35.05 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0529  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  33.94 
 
 		 333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 835 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  36.21 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1268  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.86 
 
 		 356 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.14735 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  34.77 
 
 		 330 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  34.77 
 
 		 330 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  34.77 
 
 		 330 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 313 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1338  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  32.33 
 
 		 306 aa  146  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3819  monosaccharide-transporting ATPase  35.92 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  31.09 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  29.75 
 
 		 334 aa  142  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4061  monosaccharide-transporting ATPase  34.92 
 
 		 343 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3277  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  29.75 
 
 		 334 aa  142  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  31.45 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  30.34 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2307  carbohydrate ABC transporter permease  35.55 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2408  monosaccharide-transporting ATPase  35.55 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.405486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  32.44 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  32.42 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  32.11 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  32.11 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  32.11 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  32.11 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  34.29 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1405  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 		 352 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  31.77 
 
 		 311 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  31.77 
 
 		 311 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4369  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2300  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 325 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.047503  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  31.63 
 
 		 335 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  33.44 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2034  Monosaccharide-transporting ATPase  34.2 
 
 		 326 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0584323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 334 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  31.46 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  33.01 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  32.15 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3318  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  31.13 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  31.61 
 
 		 333 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  31.78 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  31.78 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  31.78 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1813  sugar ABC transporter, permease protein  32.15 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  31.78 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2256  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0269001 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  31.78 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  31.78 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2075  carbohydrate ABC transporter permease  32.15 
 
 		 279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  31.78 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0811  carbohydrate ABC transporter permease  32.15 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  31.53 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  31.78 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1102  carbohydrate ABC transporter permease  32.15 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  30.77 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  31.71 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  30.72 
 
 		 342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  31.21 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  31.09 
 
 		 341 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  32.47 
 
 		 339 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7476  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.55 
 
 		 334 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  33.44 
 
 		 321 aa  129  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>