More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1850 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  82.63 
 
 
497 aa  832    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  100 
 
 
497 aa  999    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  78.46 
 
 
499 aa  773    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  65.45 
 
 
496 aa  636    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  67.89 
 
 
497 aa  675    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  61.85 
 
 
488 aa  596  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  61.17 
 
 
526 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  59.36 
 
 
496 aa  555  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3332  hypothetical protein  61.31 
 
 
567 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.994828 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  42.37 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  44.14 
 
 
489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  44.93 
 
 
494 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  42.77 
 
 
479 aa  334  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  43.2 
 
 
473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  43.2 
 
 
473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  42.89 
 
 
489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  43.2 
 
 
473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  40.84 
 
 
477 aa  326  7e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  43.7 
 
 
486 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  41.8 
 
 
475 aa  313  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  41.26 
 
 
489 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  41.9 
 
 
492 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  39.72 
 
 
474 aa  299  7e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  41.09 
 
 
515 aa  294  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2188  monooxygenase, FAD-binding  39.8 
 
 
503 aa  293  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.053184  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  41.78 
 
 
488 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  40.08 
 
 
503 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  38.13 
 
 
506 aa  267  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2166  oxygenase  38.59 
 
 
522 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229966  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4465  putative oxygenase  36.28 
 
 
578 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164502  normal  0.0132982 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2589  monooxygenase FAD-binding  36.38 
 
 
506 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388814  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2639  putative oxygenase  36.53 
 
 
515 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  38.12 
 
 
486 aa  243  7.999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2189  monooxygenase, FAD-binding  36.81 
 
 
490 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0791667  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2809  monooxygenase FAD-binding  37.07 
 
 
518 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0721034  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8778  putative monooxygenase  37.2 
 
 
492 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  38.49 
 
 
485 aa  240  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  37.93 
 
 
478 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  38.21 
 
 
493 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 
499 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  37.38 
 
 
479 aa  234  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2459  monooxygenase FAD-binding  35.85 
 
 
509 aa  234  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.985145  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  37.47 
 
 
477 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0013  putative monooxygenase  35.76 
 
 
519 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  38.09 
 
 
478 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  38.09 
 
 
478 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0743  monooxygenase, FAD-binding  38.07 
 
 
509 aa  230  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0301082 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1223  putative rifampin monooxygenase  35.05 
 
 
471 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  38.41 
 
 
487 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  33.19 
 
 
483 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3504  monooxygenase FAD-binding  37.11 
 
 
515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4514  monooxygenase FAD-binding  34.92 
 
 
508 aa  219  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  32.35 
 
 
483 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  34.38 
 
 
503 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  37.91 
 
 
630 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  35.6 
 
 
480 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  34.98 
 
 
549 aa  212  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  35.5 
 
 
479 aa  211  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  31.48 
 
 
574 aa  206  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  32.68 
 
 
574 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  32.74 
 
 
571 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  37.03 
 
 
493 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  36.52 
 
 
486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  37.31 
 
 
461 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  34.18 
 
 
548 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  34.18 
 
 
548 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  33.46 
 
 
548 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  33.46 
 
 
548 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  33.88 
 
 
548 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  33.52 
 
 
611 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  33.58 
 
 
550 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  33.76 
 
 
550 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  33.46 
 
 
548 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  33.46 
 
 
548 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  36.01 
 
 
486 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  33.27 
 
 
538 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  33.27 
 
 
538 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  32.97 
 
 
547 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  32.66 
 
 
548 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  35.27 
 
 
535 aa  189  8e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  34.12 
 
 
546 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  36.86 
 
 
540 aa  186  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  38.74 
 
 
546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  35.03 
 
 
544 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  34.69 
 
 
505 aa  183  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  33.66 
 
 
501 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  34.93 
 
 
506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  33.49 
 
 
968 aa  181  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  32.73 
 
 
505 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  32.18 
 
 
529 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  39.83 
 
 
481 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  30.3 
 
 
566 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  37.03 
 
 
489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  34.46 
 
 
537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  34.46 
 
 
537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  34.46 
 
 
537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  34.6 
 
 
498 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  35.19 
 
 
477 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  33.46 
 
 
511 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  34.11 
 
 
506 aa  169  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>