42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1208 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1208  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  100 
 
 		 314 aa  646    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  hitchhiker  0.000180052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1065  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein  96.18 
 
 		 314 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00053562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0762  SurA domain-containing protein  68.79 
 
 		 315 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1539  hypothetical protein  63.21 
 
 		 315 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1760  putative survival protein surA precursor (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA)  46.34 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0676  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.86 
 
 		 318 aa  252  7e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238663  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0684  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  44.86 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2604  SurA domain-containing protein  44.55 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.960846  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0505  SurA domain-containing protein  36.45 
 
 		 325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2835  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  30.66 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  0.151219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2343  hypothetical protein  26.98 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962094  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2310  hypothetical protein  26.82 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2477  hypothetical protein  27.56 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2969  hypothetical protein  27.13 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.140697  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1680  hypothetical protein  25.82 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.282986  normal  0.933531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3828  hypothetical protein  27.1 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.068458  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0653  hypothetical protein  27.37 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2224  hypothetical protein  26.86 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3474  SurA domain  27.89 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1476  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.72 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2527  SurA domain-containing protein  26.52 
 
 		 452 aa  62.4  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0899  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.67 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1811  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  27.15 
 
 		 422 aa  59.3  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201537 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2077  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.08 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3341  SurA domain-containing protein  23.16 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814478 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0105  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase surA  22.74 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.507131  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0410  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.42 
 
 		 446 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.78 
 
 		 427 aa  55.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1187  SurA domain protein  25 
 
 		 398 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614007  normal  0.705805 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2903  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.3 
 
 		 435 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0433  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.62 
 
 		 444 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0216179  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1547  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.3 
 
 		 435 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1223  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.42 
 
 		 435 aa  51.2  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0143633  normal  0.258985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0989  SurA domain protein  24.35 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.47061  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1118  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.35 
 
 		 405 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.198306 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0739  L-ribulokinase  23.39 
 
 		 430 aa  49.3  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3043  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.2 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0946  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.85 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323241  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1455  SurA domain protein  22.63 
 
 		 438 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0418  SurA domain  27.27 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.027362  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0794  hypothetical protein  22.69 
 
 		 399 aa  43.5  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2327  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.33 
 
 		 442 aa  43.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110216  normal  0.9972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>