More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5387 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5387  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138805  normal  0.471727 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2701  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
159 aa  127  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0065289  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  37.25 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3060  transcriptional regulator, AsnC family  38.56 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 
155 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
155 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  42 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
163 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
157 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0006  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
163 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
163 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
163 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
152 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
163 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 
154 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
152 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0581  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
151 aa  113  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58208  hitchhiker  0.000000374814 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
181 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
181 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
181 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
181 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  34.59 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  111  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
152 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
152 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  36.18 
 
 
159 aa  111  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  33.96 
 
 
162 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
152 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
152 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
152 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
152 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
152 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
152 aa  110  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
152 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
164 aa  110  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
160 aa  110  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
175 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  33.96 
 
 
162 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
152 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004016  putative HTH-type transcriptional regulator ybaO  35.95 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0925  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.69749e-48 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 
173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  34.71 
 
 
174 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  35.53 
 
 
169 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0739  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
164 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0726  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
164 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  34.71 
 
 
174 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0994  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 
164 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  35.53 
 
 
159 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
163 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  34.71 
 
 
174 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2868  transcriptional regulator, AsnC family  35.95 
 
 
153 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
175 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
163 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  34.71 
 
 
174 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0920  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.681617  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
175 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01449  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
164 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
164 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  36.67 
 
 
229 aa  107  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
159 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
154 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
158 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 
159 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
158 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4452  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 
164 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00957893  normal  0.739867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
159 aa  107  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
154 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
159 aa  107  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
154 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
154 aa  107  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
164 aa  107  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
158 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>