86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4439 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4439  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 339 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  51.41 
 
 		 339 aa  282  7.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1066  homoserine kinase  47.96 
 
 		 302 aa  252  6e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0153497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  41.16 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  41.64 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2246  aminoglycoside phosphotransferase  36.19 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  35.69 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  32.89 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  32.89 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  32.89 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  30.48 
 
 		 333 aa  145  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  34.11 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  32.12 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  30.12 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  30.92 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  30.26 
 
 		 336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6183  hypothetical protein  30.52 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0171293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3252  aminoglycoside phosphotransferase  32.2 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  30.74 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2425  aminoglycoside phosphotransferase  32.31 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.55374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  30.32 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5041  aminoglycoside phosphotransferase  28.53 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3424  aminoglycoside phosphotransferase  30.72 
 
 		 375 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1068  aminoglycoside phosphotransferase  32.73 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.029668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  33.62 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2553  hypothetical protein  25.96 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000883615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0604  hypothetical protein  22.86 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0637  hypothetical protein  22.86 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0548  hypothetical protein  22.54 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3200  aminoglycoside phosphotransferase  26.99 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0548  hypothetical protein  22.22 
 
 		 323 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4665  hypothetical protein  24.27 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.970638  hitchhiker  5.6288599999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0693  hypothetical protein  21.73 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0550  aminoglycoside phosphotransferase  23.42 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0672  hypothetical protein  23.3 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0292  aminoglycoside phosphotransferase  24.62 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0260257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2594  hypothetical protein  23.74 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11466e-17 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1059  homoserine kinase  29.56 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2591  hypothetical protein  22.27 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0632128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2405  hypothetical protein  23 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2952  hypothetical protein  23.03 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000861899  normal  0.0228884 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2581  hypothetical protein  23 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0705  hypothetical protein  22.29 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2359  hypothetical protein  23 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000276789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0766  hypothetical protein  22.73 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  30 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0135  hypothetical protein  21.85 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0652  homoserine kinase  29.13 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252204  normal  0.14086 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2773  hypothetical protein  23.11 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179164  decreased coverage  0.00000000008216 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6026  homoserine kinase  29.41 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7259  homoserine kinase  30.33 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  25.66 
 
 		 349 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2483  phosphotransferase enzyme family, putative  21.45 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.882725  normal  0.741091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0661  aminoglycoside phosphotransferase  25.26 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  28.75 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3141  serine/threonine protein kinase  22.56 
 
 		 355 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.165863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3744  homoserine kinase  28.14 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53483  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1341  homoserine kinase  30.47 
 
 		 326 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.528429  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2807  hypothetical protein  20.36 
 
 		 309 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4750  homoserine kinase  30.47 
 
 		 327 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0685  homoserine kinase  27.51 
 
 		 321 aa  49.3  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  27.5 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0505  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00132801  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0481  homoserine kinase  28.26 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0476  homoserine kinase  28.07 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.551837  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2334  homoserine kinase  28.51 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.092459 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  23 
 
 		 327 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3817  homoserine kinase  27.24 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1456  serine/threonine protein kinase  23.28 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  26.84 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1872  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  26.96 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2721  aminoglycoside phosphotransferase  30.04 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.441003 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1652  homoserine kinase  29.63 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2594  homoserine kinase  27.48 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.818259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2817  homoserine kinase  28.24 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  30 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0565  homoserine kinase  29.25 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.588642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2828  hypothetical protein  19.56 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00879234  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  27.18 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4394  homoserine kinase  35.58 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0590  homoserine kinase  28.45 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.954317  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2990  aminoglycoside phosphotransferase  29.5 
 
 		 329 aa  43.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  25.16 
 
 		 346 aa  42.7  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  26.71 
 
 		 359 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  24.84 
 
 		 346 aa  42.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>