104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2173 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2173  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0680513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1101  hypothetical protein  41.22 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3158  hypothetical protein  41.58 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1317  hypothetical protein  41.33 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0336  hypothetical cytosolic protein  34.39 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1853  hypothetical protein  34.39 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4572  hypothetical protein  37.05 
 
 		 290 aa  129  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.91 
 
 		 343 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.981834  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3050  hypothetical protein  28.94 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0239  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.69 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal  0.808086 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2907  hypothetical protein  30.12 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1883  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.59 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1787  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.75 
 
 		 328 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_705  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.08 
 
 		 290 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000337402  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2147  hypothetical protein  32.61 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.687516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0725  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.54 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0801  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  28.98 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000364861  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0367  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  25 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.288045  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3372  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.12 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.403288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0140  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.77 
 
 		 307 aa  96.3  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.14549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1878  hypothetical protein  31.67 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0298  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.99 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3016  hypothetical protein  26.34 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.77776 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0100  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.5 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.982227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3227  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  30 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0099  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1550  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.88 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1788  hypothetical protein  23.99 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3715  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.1 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1455  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.88 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3719  hypothetical protein  32.56 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.562569 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2408  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0684106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0154  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  28 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000106629  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01781  hypothetical protein  31.39 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0631  Domain of unknown function DUF2520  30.15 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0091  putative cytoplasmic protein  28.97 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0159  hypothetical protein  29.47 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0428  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1320  hypothetical protein  24.56 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0322  hypothetical protein  28.74 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.28 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12870  hypothetical protein  29.81 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0057272  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0566  Domain of unknown function DUF2520  30.42 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2885  hypothetical protein  29.29 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1022  hypothetical protein  29.8 
 
 		 264 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000881326  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3427  putative cytoplasmic protein  26.71 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1098  hypothetical protein  29.8 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2952  hypothetical protein  23.36 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.588576  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0023  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.54 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4284  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3111  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.89 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.727312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1982  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  24.19 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09808  hypothetical protein  25.64 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0882  hypothetical protein  28.57 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4547  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.03 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3475  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.03 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128821  normal  0.109237 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1267  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.3 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0574  hypothetical protein  23.57 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2097  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.66 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2448  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.49 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1423  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  30.43 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.170532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4719  hypothetical protein  32.46 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000278675 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3216  oxidoreductase domain protein  26.37 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4050  hypothetical protein  30.84 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5365  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  27.05 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.937795  hitchhiker  0.00190793 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0808  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.69 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7461  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32020  hypothetical protein  30.5 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1523  hypothetical protein  30.26 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0111992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8384  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.18 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.841409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0819  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.69 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1611  hypothetical protein  23.2 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.575841  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0470  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.38 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0949  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.38 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.522704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6619  hypothetical protein  25.27 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4488  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.9 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0659  hypothetical protein  24.21 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.599675 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4980  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann-like domain protein  26.32 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0411301  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0911  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.45 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0324  putative cytoplasmic protein  28.01 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.471831  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0556  hypothetical protein  29.22 
 
 		 358 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4763  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  26.32 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4849  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  26.32 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0574  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.63 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0437245  normal  0.0561371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9161  putative cytoplasmic protein  26.82 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5149  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  26.24 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4008  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  27.95 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0459  hypothetical protein  27.16 
 
 		 272 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01320  hypothetical protein  24.14 
 
 		 316 aa  52.4  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3027  putative NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.37 
 
 		 378 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1643  hypothetical protein  39.13 
 
 		 256 aa  52.4  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.639478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2157  hypothetical protein  28.21 
 
 		 378 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0752  hypothetical protein  28.21 
 
 		 378 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2586  hypothetical protein  28.21 
 
 		 378 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328461  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3082  putative NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.21 
 
 		 378 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2027  putative NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.21 
 
 		 378 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35560  hypothetical protein  27.54 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0380353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  28.08 
 
 		 618 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2313  putative coenzyme F420-dependent NADP oxidoreductase  31.12 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0120565  hitchhiker  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0634  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  29.63 
 
 		 344 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.165538  normal  0.317687 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>