More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3601 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  100 
 
 
402 aa  818    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  69.7 
 
 
387 aa  514  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  67.71 
 
 
373 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  68.61 
 
 
381 aa  463  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  58.73 
 
 
377 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  48.28 
 
 
386 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  38.27 
 
 
386 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  39.84 
 
 
403 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  43.7 
 
 
397 aa  269  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  39.72 
 
 
385 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  41.01 
 
 
396 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  38.87 
 
 
385 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  39.9 
 
 
385 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  39.9 
 
 
385 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  38.26 
 
 
385 aa  255  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  39.63 
 
 
385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  38.03 
 
 
382 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  36.59 
 
 
383 aa  246  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  41.08 
 
 
385 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  37.54 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  39.19 
 
 
391 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  37.18 
 
 
382 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  37.54 
 
 
382 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  35.21 
 
 
378 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  41.19 
 
 
406 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  36.29 
 
 
395 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  39.39 
 
 
400 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  34.99 
 
 
410 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  36.56 
 
 
421 aa  200  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  37.6 
 
 
398 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  38.02 
 
 
404 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.7 
 
 
404 aa  193  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  39.89 
 
 
395 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  33.92 
 
 
400 aa  193  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  37.82 
 
 
412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  31.04 
 
 
422 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  38.15 
 
 
399 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  30.79 
 
 
404 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  35.39 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  38.4 
 
 
373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  35.24 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  30.79 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  31.4 
 
 
405 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  36.44 
 
 
412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  30.79 
 
 
404 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  36.01 
 
 
390 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  35.73 
 
 
391 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  35.73 
 
 
391 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  35 
 
 
414 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  37.78 
 
 
399 aa  179  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  36.59 
 
 
389 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  35.36 
 
 
420 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  35.5 
 
 
401 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  35.09 
 
 
427 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  35.17 
 
 
396 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  34.2 
 
 
402 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  33.61 
 
 
413 aa  170  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  36.39 
 
 
400 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  33.62 
 
 
402 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  33.43 
 
 
400 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  35.59 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  35.04 
 
 
395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  34.2 
 
 
397 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  34.22 
 
 
416 aa  166  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  33.91 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  33.91 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  33.91 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  33.91 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  33.82 
 
 
397 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  32.58 
 
 
402 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  35.92 
 
 
397 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  33.43 
 
 
402 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  31.61 
 
 
426 aa  162  9e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  31.05 
 
 
448 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  32.29 
 
 
411 aa  161  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  32.25 
 
 
401 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  33.14 
 
 
402 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  34.39 
 
 
402 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  34.84 
 
 
398 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  32.84 
 
 
402 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  36.62 
 
 
397 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  30.77 
 
 
427 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  32.93 
 
 
384 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  33.15 
 
 
420 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  35.56 
 
 
412 aa  156  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  34.79 
 
 
425 aa  155  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  35.52 
 
 
444 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  34.83 
 
 
414 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  34.83 
 
 
414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  32.65 
 
 
421 aa  152  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  28.95 
 
 
413 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  35.51 
 
 
390 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  34.56 
 
 
402 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  28.99 
 
 
377 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  32.64 
 
 
404 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  33.06 
 
 
395 aa  150  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  34.83 
 
 
402 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  31.23 
 
 
711 aa  149  9e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  31.94 
 
 
395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  32.81 
 
 
430 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>