65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0454 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0454  cysteine dioxygenase type I  100 
 
 		 184 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0396  cysteine dioxygenase type I  68.89 
 
 		 184 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0149847 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1609  cysteine dioxygenase type I  41.24 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2860  metal-dependent protein  40.34 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1753  cysteine dioxygenase type I  47.15 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.612269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2860  cysteine dioxygenase type I family protein  47.5 
 
 		 218 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5442  cysteine dioxygenase type I  35.8 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124892  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1378  putative cysteine dioxygenase, type I  48.33 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1374  putative cysteine dioxygenase, type I  48.33 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0544764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1507  cysteine dioxygenase type I family protein  48.33 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2674  cysteine dioxygenase type I  40.87 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2159  hypothetical protein  35.03 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1987  cysteine dioxygenase type I  40.34 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.935049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3258  cysteine dioxygenase type I  28.74 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4259  cysteine dioxygenase type I  28.74 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00114989  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4107  cysteine dioxygenase type I  28.74 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289142  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3544  cysteine dioxygenase type I  37.61 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.272534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3576  cysteine dioxygenase type I  30.13 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1752  double-stranded beta helix superfamily protein  29.31 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188529  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4331  cysteine dioxygenase type I  30 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.173506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3601  hypothetical protein  32.76 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4156  cysteine dioxygenase type I  30.95 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.793001  normal  0.481367 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3683  cysteine dioxygenase type I  30.16 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1793  hypothetical protein  32.76 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1548  cysteine dioxygenase type I  35.34 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2664  cysteine dioxygenase type I  37.96 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000978077  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30440  putative enzyme  29.61 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1341  hypothetical protein  35.25 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1712  cysteine dioxygenase type I  37.86 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1508  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily-like protein  35.82 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.221048 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5233  cysteine dioxygenase type I  37.07 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.220688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30970  cysteine dioxygenase type I protein  32.54 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3618  cysteine dioxygenase type I  32.46 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3216  hypothetical protein  31.58 
 
 		 202 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1914  hypothetical protein  31.25 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2513  cysteine dioxygenase type I  30.95 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3875  cysteine dioxygenase type I  32.76 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2701  hypothetical protein  33.88 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.463079  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1656  cysteine dioxygenase type I  39.06 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1882  cysteine dioxygenase type I  26.8 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0884885  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2216  cysteine dioxygenase type I  30.17 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100364  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2415  hypothetical protein  34.17 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4463  cysteine dioxygenase type I  31.58 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2651  hypothetical protein  33.88 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000207337 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4597  cysteine dioxygenase type I  31.58 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.459567  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2378  hypothetical protein  33.88 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2633  hypothetical protein  33.88 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2453  hypothetical protein  33.88 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00159574  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0608  hypothetical protein  35.45 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0862  hypothetical protein  28.39 
 
 		 188 aa  62  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186079  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2660  hypothetical protein  32.5 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000212284  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5045  cysteine dioxygenase type I  30.17 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2667  hypothetical protein  32.5 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0160743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2507  cysteine dioxygenase type I  32.5 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0215877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2657  hypothetical protein  32.23 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2309  cysteine dioxygenase type I  27.63 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54991  normal  0.0277582 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0692  hypothetical protein  60 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0347117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1178  cysteine dioxygenase type I family protein  60 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04081  cysteine dioxygenase Cdo1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05570)  30.33 
 
 		 216 aa  48.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0171854  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3482  hypothetical protein  34.45 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206072  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0030  cysteine dioxygenase type I  32.73 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174778  hitchhiker  0.0000000079419 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43654  cysteine dioxygenase  32.94 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.277874 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0527  hypothetical protein  23.62 
 
 		 189 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3973  hypothetical protein  27.45 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0551  hypothetical protein  23.44 
 
 		 189 aa  41.6  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>